Gephi - 带有彩色节点的 open.networkx

Question

我有一个相当大的网络（34594 个节点和 3897 个边）。 我在 Python 中创建了一个 Networkx.network，并根据节点的 label 为节点赋予颜色。 label 根据开头字母将节点链接到 5 个国家。 在 Python 中，一切正常，但出于可视化目的，我导出文件 (.gexf) 以在 Gephi 中打开它。 但是，当我再次打开它时，它不再有 colors。 有一个插件（给节点赋予颜色），但是，似乎我必须手动更改颜色，每个节点一个节点。 您可以导入我最初想做的电子表格，并将其用作某种类型的查找表。 但是，这是不可能的，您只能从那里导入节点，但这些节点未链接到 .network。

有人对如何解决这个问题有任何见解吗？

Answer 1

由于您使用的是networkx ，我将提出一个非常简单的脚本，它将所有节点和 colors 每个节点迭代为blue 。

import networkx as nx

# Construct a simple line graph
G = nx.path_graph(4)

for v in nx.nodes(G):
    # Set the viz attribute for each node
    G.nodes[v]["viz"] = {} 
    # Set the color to blue
    G.nodes[v]["viz"]["color"] = {"a":0, "r": 0, "g": 0, "b": 255}
     
# output a sample graph
nx.write_gexf(G, 'test.gexf')

G.nodes[v]["viz"] = {}行需要将viz字典添加到每个节点，然后我们添加每个节点的 ARGB 值。 在此示例a=0且RGB=(0,0,255) ，或者简单地说，蓝色。

该脚本基于networkx 文档，有一些小改动。 添加 colors 也应该可以通过调整nx.setNodeAttibutes来实现，如此处所示。 只是GEXF格式，需要viz属性，然后是对应的color 。