[英]How to convert string including an array into an array in python?
我正在处理生物信息的分配。
我已将一组分子的 SMILES 转换为指纹 (fp),数据框如下所示:
然后使用 to_csv 将文件保存到 CSV 文件。
然后用pd.read_csv
读取文件,指纹变成一个字符串,看起来像:
我使用了各种方法:
ast.literal_eval(fp_df['fp'])
,然后出现错误: ValueError: malformed node or string:
,来自此处投票最多的答案list(fp_df['fp'])
不能改变字符串的类型[n.strip() for n in x]
不起作用: 其他的方法也都试过了。
我可以请你帮忙处理一下吗? 提前致谢。
如果您的价值如下所示:
"[1 0 0 1 1 0]"
然后你可以通过以下方式将它变成一个列表:
values = value.lstrip("[").rstrip("]").split()
但这些值仍将是数字字符串,因此您可以通过以下方式强制转换为int
:
values = [int(n) for n in value.lstrip("[").rstrip("]").split()]
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