在 Ubuntu 中使用 python 而不是 python3 运行

Question

我在 Windows 中通过 ubuntu 运行 Linux。 我的终端有 python3 而不是 python。 我正在使用一个名为 PASTA 的包，它使用 python 的命令作为：

python run_pasta.py -i input_fasta 

因为，我有 python3，我试图以这种方式运行它：

python3 run_pasta.py -i ALL_FASTA.fasta -d protein --aligner=probcons

这给了我以下错误，谁能告诉我如何解决这个问题？

PASTA INFO: 执行整个数据矩阵的初始对齐... PASTA 失败，因为它尝试运行的程序之一失败。 失败的调用是：“/mnt/f/Projects/WoldringLab/AnalyzingGenerativeModel/pasta-code/pasta/bin/hmmeralign”“/home/aryaman3900/.pasta/pastajob/temp569cp9x3/init_aln/temphmmeralignourpmnyw/input.fasta”“ /home/aryaman3900/.pasta/pastajob/temp569cp9x3/init_aln/query-0.fasta" "/home/aryaman3900/.pasta/pastajob/temp569cp9x3/init_aln/temphmmeralignourpmnyw/input.aligned" "氨基"

/usr/bin/env: 'python': 没有这样的文件或目录

Answer 1

您可以创建从python3到python的符号链接（符号链接）。 这将做的只是将对/usr/bin/python的每个调用映射到您的 python3 可执行文件：

sudo ln -s $(which python3) /usr/bin/python

您可以通过man ln阅读其手册页来了解有关ln命令的更多信息。