如何在 plotly 快速热图的 hover 上添加 p 值？

Question

通过 SciPy，我得到了 Spearman 相关性和 p 值。

使用来自 plotly express 的 px.imshow，我得到以下 plot：

此时 hover 显示： Feature_1 、 Feature_2和它们各自的Correlation 。

如何使 hover 也显示p_value ？

Answer 1

如果您查看plotly.figure_factory.create_annotated_heatmap的文档，您将找不到任何更改 hover 数据的属性。 因此，我建议使用plotly.graph_objects如下：

代码

import numpy as np
import plotly.graph_objects as go

z = np.round(np.random.rand(5,5),2)
p = np.round(np.random.rand(5,5),2)
    
feature_1 =  ['Buttinia1 type',
      'Buttinia2 type',
      'Buttinia3 type',
      'Buttinia4 type',
      'Buttinia5 type']

feature_2 = ['Diporopollis aff. assamica',
     'Esporas, hifas y/o cuerpos fructiferos',
     'Forro de foraminífero',
     'Sphaeromorpho',
     'Scolecodonte']

hovertext = np.empty(z.shape, dtype=object)

for i, ftr2 in enumerate(feature_2):
    for j,ftr1 in enumerate(feature_1):
        hovertext[i,j] = f'feature 1: {ftr1}<br />feature 2: {ftr2}<br />Correlation: {z[i,j]}<br />p-value: {p[i,j]}'      

fig= go.Figure(go.Heatmap(z=z,
                          x=feature_1,
                          y=feature_2,
                          hoverinfo='text',
                          hovertext=hovertext,
                          texttemplate="%{z}"))
fig.show()

Output

您可以使用df.feature1.unique().tolist()定义功能 1 nd 2