在Windows XP上的R中进行多核处理 - 通过doMC和foreach

Question

我发布这个问题是为了询问如何在Windows XP机器上优化R中多个处理器的使用。

目前我正在创建4个脚本（每个脚本用例如for（i in 1：100）和（i in 101：200）等）我同时在4个不同的R会话中运行。 这似乎使用了所有可用的cpu。

但是，我希望这样做更有效率。 一种解决方案可能是使用“doMC”和“foreach”软件包，但这在Windows机器上的R中是不可能的。

例如

library("foreach")
library("strucchange")
library("doMC") # would this be possible on a windows machine?
registerDoMC(2)  # for a computer with two cores (processors)
## Nile data with one breakpoint: the annual flows drop in 1898
## because the first Ashwan dam was built
data("Nile")
plot(Nile)

## F statistics indicate one breakpoint
fs.nile <- Fstats(Nile ~ 1)
plot(fs.nile)
breakpoints(fs.nile)     # , hpc = "foreach" --> It would be great to test this.
lines(breakpoints(fs.nile))

任何解决方案或建议？

Answer 1

尝试使用doSNOW并行后端 - 它在Windows上支持开箱即用。 与雪插座群集一起使用。

Answer 2

为了完整起见，这里是Tal的评论所要求的答案，它提供了一个简单而便携的替代方案。 答案包括跑步

 > library(snow)
 > help(makeCluster)

并从示例的顶部运行前三行代码：部分：

> cl <- makeCluster(c("localhost","localhost"), type = "SOCK")
> clusterApply(cl, 1:2, get("+"), 3)
[[1]]
[1] 4

[[2]]
[1] 5

> stopCluster(cl)
> .Platform$OS.type
[1] "windows"
> 

真的那么难吗？

像doSNOW这样的附加软件包以及之后的foreach可以以便携的方式使用它。

Answer 3

您可以尝试doSMP REvolution Computing中的doSMP 。 有关更多信息，请参阅此博客文章： 使用R进行并行多核处理（在Windows上）