xTable，Sweave，R，交叉表中的计数和百分比

Question

编辑：基于aL3xa的答案，我在下面修改了他的语法。 不完美，但越来越近了。 我还没有找到一种方法来为列或行创建xtable accept \\ multicolumn {}参数。 似乎Hmisc在幕后处理这些类型的任务，但看起来有点想要了解那里发生了什么。 有没有人有Hmisc乳胶功能的经验？

ctab <- function(tab, dec = 2, margin = NULL) {
    tab <- as.table(tab)
    ptab <- paste(round(prop.table(tab, margin = margin) * 100, dec), "%", sep = "")
    res <- matrix(NA, nrow = nrow(tab) , ncol = ncol(tab) * 2, byrow = TRUE)
    oddc <- 1:ncol(tab) %% 2 == 1
    evenc <- 1:ncol(tab) %% 2 == 0
    res[,oddc ] <- tab
    res[,evenc ] <- ptab
    res <- as.table(res)
    colnames(res) <- rep(colnames(tab), each = 2)
    rownames(res) <- rownames(tab)
    return(res)
}

我想创建一个格式化为LaTeX输出的表，其中包含每个列或变量的计数和百分比。 我还没有找到解决这个问题的现成解决方案，但我觉得我必须在某种程度上重新创建方向盘。

我已经为直表制定了一个解决方案，但我正在努力采用交叉制表的东西。

首先是一些样本数据：

#Generate sample data
dow <- sample(1:7, 100, replace=TRUE)
purp <- sample(1:4, 100, replace=TRUE)
dow <- factor(dow, 1:7, c("Mon", "Tues", "Wed", "Thurs", "Fri", "Sat", "Sun"))
purp <- factor(purp, 1:4, c("Business", "Commute", "Vacation", "Other"))

现在工作的直接标签功能：

customTable <- function(var, capt = NULL){
    counts <- table(var)
    percs <- 100 * prop.table(counts)       

    print(
        xtable(
            cbind(
                Count = counts
                , Percent = percs
            )
        , caption = capt
        , digits = c(0,0,2)
        )
    , caption.placement="top"
    )
}

#Usage
customTable(dow, capt="Day of Week")
customTable(purp, capt="Trip Pupose")

有没有人有任何建议采用这个交叉表（即一周一天的旅行目的）？ 这是我目前编写的，它不使用xtable库和ALMOST工作，但不是动态的，并且使用起来非常难看：

#Create table and percentages
a <- table(dow, purp)
b <- round(prop.table(a, 1),2)

#Column bind all of the counts & percentages together, this SHOULD become dynamic in future
d <- cbind( cbind(Count = a[,1],Percent =  b[,1])
        , cbind(Count = a[,2], Percent = b[,2])
        , cbind(Count = a[,3], Percent = b[,3])
        , cbind(Count = a[,4], Percent = b[,4])
)

#Ugly function that needs help, or scrapped for something else
crossTab <- function(title){
    cat("\\begin{table}[ht]\n")
    cat("\\begin{center}\n")
    cat("\\caption{", title, "}\n", sep="") 

    cat("\\begin{tabular}{rllllllll}\n")
    cat("\\hline\n")

    cat("", cat("", paste("&\\multicolumn{2}{c}{",colnames(a), "}"), sep = ""), "\\\\\n", sep="")
    c("&", cat("", colnames(d), "\\\\\n", sep=" & "))
    cat("\\hline\n")
    c("&", write.table(d, sep = " & ", eol="\\\\\n", quote=FALSE, col.names=FALSE))

    cat("\\hline\n")
    cat("\\end{tabular}\n")
    cat("\\end{center}\n")
    cat("\\end{table}\n")   
}   

crossTab(title = "Day of week BY Trip Purpose")

Answer 1

在Tables-package中它是一行：

# data:
dow <- sample(1:7, 100, replace=TRUE)
purp <- sample(1:4, 100, replace=TRUE)
dow <- factor(dow, 1:7, c("Mon", "Tues", "Wed", "Thurs", "Fri", "Sat", "Sun"))
purp <- factor(purp, 1:4, c("Business", "Commute", "Vacation", "Other"))

dataframe <-  data.frame( dow, purp)

# The packages

library(tables)
library(Hmisc)

# The table
tabular(  (Weekday=dow) ~  (Purpose=purp)*(Percent("row")+ 1)    ,data=dataframe        )

# The latex table
latex(  tabular(  (Weekday=dow) ~  (Purpose=purp)*(Percent("col")+ 1)    ,data=dataframe        ))

使用booktabs，你得到这个（可以进一步定制）：

Answer 2

很好的问题，这个人困扰了我一段时间（这不是那么难，只是我像往常一样懒得......） 然而......虽然问题很好，但我担心，你的方法不是。 你可以（误）使用名为xtable的无价包装。 此外，这个问题太常见了 - 很有可能已经有一些现成的解决方案可以安装在互联网上 。

有一天我将要一劳永逸地解决这个问题（我将在GitHub上发布代码）。 主要观点有点像：你想要一个单元格内的频率和/或百分比值（由\\分隔）或连续的绝对和相对频率（或％）的行？ 我会选择^第二个，所以我现在将发布一个“急救”解决方案：

ctab <- function(tab, dec = 2, ...) {
  tab <- as.table(tab)
  ptab <- paste(round(prop.table(tab) * 100, dec), "%", sep = "")
  res <- matrix(NA, nrow = nrow(tab) * 2, ncol = ncol(tab), byrow = TRUE)
  oddr <- 1:nrow(tab) %% 2 == 1
  evenr <- 1:nrow(tab) %% 2 == 0
  res[oddr, ] <- tab
  res[evenr, ] <- ptab
  res <- as.table(res)
  colnames(res) <- colnames(tab)
  rownames(res) <- rep(rownames(tab), each = 2)
  return(res)
}

现在尝试以下方法：

data(HairEyeColor)           # load an appropriate dataset
tb <- HairEyeColor[, , 1]    # choose only male respondents
ctab(tb)
      Brown  Blue   Hazel Green
Black 32     11     10    3    
Black 11.47% 3.94%  3.58% 1.08%
Brown 53     50     25    15   
Brown 19%    17.92% 8.96% 5.38%
Red   10     10     7     7    
Red   3.58%  3.58%  2.51% 2.51%
Blond 3      30     5     8    
Blond 1.08%  10.75% 1.79% 2.87%

确保你加载了xtable包并使用print （它是一个通用函数，所以你必须传递一个xtable对象）。 禁止行名称很重要。 我明天会优化这个 - 它应该是xtable兼容的。 现在是我所在时区的凌晨3点，所以有了这些话，我将结束我的回答：

print(xtable(ctab(tb)), include.rownames = FALSE)

干杯!

Answer 3

使用来自Hmisc包装的latex multicolumn 柱并不算太糟糕。 这个最小的Sweave文档：

\documentclass{article}
\begin{document}

<<echo = FALSE,results = tex>>=
library(Hmisc)
dow <- sample(1:7, 100, replace=TRUE)
purp <- sample(1:4, 100, replace=TRUE)
dow <- factor(dow, 1:7, c("Mon", "Tues", "Wed", "Thurs", "Fri", "Sat", "Sun"))
purp <- factor(purp, 1:4, c("Business", "Commute", "Vacation", "Other"))
tbl <- table(dow,purp)
tbl_prop <- round(100 * prop.table(tbl,1),2)

tbl_df <- as.data.frame.matrix(tbl)
tbl_prop_df <- as.data.frame.matrix(tbl_prop)
colnames(tbl_prop_df) <- paste(colnames(tbl_prop_df),"1",sep = "")
df <- cbind(tbl_df,tbl_prop_df)[,ggplot2:::interleave(1:4,5:8)]
colnames(df) <- rep(c('n','\\%'),times = 4)

latex(object=df,file="",cgroup = colnames(tbl_df),
      colheads = NULL,rowlabel = "",
      center = "centering",collabel.just = rep("r",8))
@

\end{document}

为我生产这个：

显然，我已经硬编码了很多东西，并且可能有更简单的方法来生成最终传递给latex的数据框，但这至少应该开始使用multicolum 。

另外，稍微有些问题，我在组合计数和百分比来交替列时使用了ggplot2的interleave函数。 那只是因为我很懒。

Answer 4

我无法弄清楚如何使用xtable生成多列标题，但我确实意识到我可以将我的计数和百分比连接到同一列以进行打印。 不理想，但似乎完成了工作。 这是我写的函数：

ctab3 <- function(row, col, margin = 1, dec = 2, percs = FALSE, total = FALSE, tex = FALSE, caption = NULL){
    tab <- as.table(table(row,col))
    ptab <- signif(prop.table(tab, margin = margin), dec)

    if (percs){

        z <- matrix(NA, nrow = nrow(tab), ncol = ncol(tab), byrow = TRUE) 
        for (i in 1:ncol(tab)) z[,i] <- paste(tab[,i], ptab[,i], sep = " ")
        rownames(z) <- rownames(tab)
        colnames(z) <- colnames(tab)

        if (margin == 1 & total){
            rowTot <- paste(apply(tab, 1, sum), apply(ptab, 1, sum), sep = " ")
            z <- cbind(z, Total = rowTot)
        } else if (margin == 2 & total) {
            colTot <- paste(apply(tab, 2, sum), apply(ptab, 2, sum), sep = " ")
            z <- rbind(z,Total = colTot)
        }
    } else {
        z <- table(row, col)    
    }
ifelse(tex, return(xtable(z, caption)), return(z))
}

可能不是最终产品，但确实允许参数的一些灵活性。 在最基本的级别，只是table()的包装，但也可以生成LaTeX格式的输出。 这是我最终在Sweave文档中使用的内容：

<<echo = FALSE>>=
for (i in 1:ncol(df)){
    print(ctab3(
        col = df[,1]
        , row = df[,i]
        , margin = 2
        , total = TRUE
        , tex = TRUE
        , caption = paste("Dow by", colnames(df[i]), sep = " ")
    ))
}
@

Answer 5

这对你有什么用？

library(reshape)
library(plyr)
df <- data.frame(dow = dow, purp = purp)

df.count <- count(df)
df.count <- ddply(df.count, .(dow), transform, p = round(freq / sum(freq),2))

df.m <- melt(df.count)

df.print <- cast(df.m, dow ~ purp + variable)

library(xtable)
xtable(df.print)

它没有给你很好的多列，我没有足够的经验与xtable来确定是否可能。 但是，如果您要编写自定义函数，则可以尝试使用df.print列名运行的df.print 。 您甚至可以编写足够通用的一个来将各种重铸数据帧作为输入。

编辑：想到一个很好的解决方案，让你更接近。 创建df.m

df.preprint <- ddply(df.m, .(dow, purp), function(x){
        x <- cast(x, dow ~ variable)
        x$value <- paste(x$freq, x$p, sep = " / ")
        return(c(value = x$value))
     }
)

df.print <- cast(df.preprint, dow ~ purp)

print(xtable(df.print), include.rownames = F)

现在，每个单元格都包含N / percent值

Answer 6

tab<-table(row, col)
ctab<-round(100*prop.table(tab,2), 2) # for column percents (see the args for prop.table)

for (i in 1:length(tab)) {
  ctab[i]<-paste(tab[i]," (", ctab[i], "%", ")", sep="")
}

require(xtable);
k<-xtable(ctab,digits=1) # make latex table

Answer 7

我意识到这个线程有点旧，但reporttools包中的tableNominal（）函数可能会提供您正在寻找的功能。