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如何在R中的函数中使用acast(reshape2)?

[英]How to use acast (reshape2) within a function in R?

我试图用acastreshape2自写的函数中,但有这样的acast没有找到我发送给它的数据的问题。

这是我的数据:

library("reshape2")
x <- data.frame(1:3, rnorm(3), rnorm(3), rnorm(3))    
colnames(x) <- c("id", "var1", "var2", "var3")
y <-melt(x, id = "id", measure = c("var1", "var2", "var3"))

y则是这样的:

  id variable      value
1  1     var1  0.1560812
2  2     var1  1.0343844
3  3     var1 -1.4157728
4  1     var2  0.8808935
5  2     var2  0.1719239
6  3     var2  0.6723758
7  1     var3 -0.7589631
8  2     var3  1.1325995
9  3     var3 -1.5744876

现在我可以通过acast把它acast回来:

> acast(y,y[,1] ~ y[,2])
        var1      var2       var3
1  0.1560812 0.8808935 -0.7589631
2  1.0343844 0.1719239  1.1325995
3 -1.4157728 0.6723758 -1.5744876

但是,当为一个应该做同样的acast编写一个小包装器时,我得到一个愚蠢的错误消息:

wrap.acast <- function(dat, v1 = 1, v2 = 2) {
    out <- acast(dat, dat[,v1] ~ dat[,v2])
    return(out)
}

wrap.acast(y)

Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'dat' not found

问题显然与环境和全局/局部变量有关。 因为它在全局环境中声明dat之后给出了其他错误消息(即,只要它们不是全局的,就找不到v1v2 )。

我想在函数中使用resahpe(特别是acast)而不必在函数外声明变量。 诀窍是什么?

谢谢。

而不是使用公式规范,使用字符规范:

acast(y, list(names(y)[1], names(y)[2]))

一个问题是你在R中滥用公式表示法。你不应该这样做

> acast(y, y[,1] ~ y[,2])
        var1       var2         var3
1  2.1726117  0.6107264  0.291446236
2  0.4755095 -0.9340976 -0.443291873
3 -0.7099464 -1.2536334  0.001105352

因为如果提供数据对象,'y'位是多余的。 如果你直接在公式中引用y的变量,那么事情很有效

> acast(y, id ~ variable)
        var1       var2         var3
1  2.1726117  0.6107264  0.291446236
2  0.4755095 -0.9340976 -0.443291873
3 -0.7099464 -1.2536334  0.001105352

并且在第二个版本中代码更具可读性。

使用acast包装器做你想做的事情将涉及使用names生成正确的公式,正如Joris所指出的那样,Hadley的解决方案要简单得多。 所以我的观点是要注意你如何在R中使用公式规范。如果正确使用公式,从长远来看,你会省去很多麻烦(虽然不是特别针对这个特殊问题)。

更正:问题不在于它没有找到dat,而是在指定的公式中找不到dat [,v1]和dat [,v2]。 Acast接受类型公式的参数,并在围绕数据框创建的临时环境中对其进行评估。 在该环境中,当函数包含在另一个函数中时,它不会找到“dat”对象。

我并没有完全关注它在全局中是如何工作的,并且在包装时没有,但如果你给acast一个公式,它也可以在函数中工作。

wrap.acast <- function(dat, v1 = 1, v2 = 2) {
    x1 <- names(dat)[v1]
    x2 <- names(dat)[v2]
    form <- as.formula(paste(x1,"~",x2))
    out <- acast(dat,form)
    return(out)
}

使用您的玩具数据:

> wrap.acast(y)
        var1      var2       var3
1 0.04095337 0.4044572 -0.4532233
2 1.23905358 1.2493187  0.7083557
3 0.72798307 0.7868746  1.7144811

我找到了一种使用超级赋值( <<- )来解决问题的非常不优雅的方法。
将功能更改为以下功能。 但是,它是非常难看的,因为它创造了仍然存在的全局变量。

wrap.acast <- function(dat, v1 = 1, v2 = 2) {
    dat <<- dat
    v1 <<- v1
    v2 <<- v2
    out <- acast(dat, dat[,v1] ~ dat[,v2])
    return(out)
}

我对其他(堵塞较少)解决方案仍然很感兴趣。

在运行函数之前:

> ls()
[1] "wrap.acast" "x"          "y"     

运行功能后:

> ls()
[1] "dat"        "v1"         "v2"         "wrap.acast" "x"         
[6] "y" 

暂无
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