Python中时间序列中两个变量的相关性？

Question

如果我有两个不同的时间序列数据集，有没有一种简单的方法来找到python中两个集合之间的相关性？

例如：

# [ (dateTimeObject, y, z) ... ]
x = [ (8:00am, 12, 8), (8:10am, 15, 10) .... ]

我如何在Python中获得y和z的相关性？

Answer 1

这里的吸收速度有点慢。 pandas（http://github.com/wesm/pandas和pandas.sourceforge.net）可能是你最好的选择。 我有偏见因为我写了但是：

In [7]: ts1
Out[7]: 
2000-01-03 00:00:00    -0.945653010936
2000-01-04 00:00:00    0.759529904445
2000-01-05 00:00:00    0.177646448683
2000-01-06 00:00:00    0.579750822716
2000-01-07 00:00:00    -0.0752734982291
2000-01-10 00:00:00    0.138730447557
2000-01-11 00:00:00    -0.506961851495

In [8]: ts2
Out[8]: 
2000-01-03 00:00:00    1.10436688823
2000-01-04 00:00:00    0.110075215713
2000-01-05 00:00:00    -0.372818939799
2000-01-06 00:00:00    -0.520443811368
2000-01-07 00:00:00    -0.455928700936
2000-01-10 00:00:00    1.49624355051
2000-01-11 00:00:00    -0.204383054598

In [9]: ts1.corr(ts2)
Out[9]: -0.34768587480980645

值得注意的是，如果您的数据是在不同的日期集上，它将计算成对相关性。 它还会自动排除NaN值！

Answer 2

Scipy有一个具有相关功能的统计模块。

from scipy import stats
# Y and Z are numpy arrays or lists of variables 
stats.pearsonr(Y, Z)

Answer 3

您可以通过协方差矩阵或相关系数来做到这一点。 http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.cov.html和http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.corrcoef.html是文档对于这个功能，前者还附带了一个如何使用它的示例（corrcoef使用非常相似）。

>>> x = [ (None, 12, 8), (None, 15, 10), (None, 10, 6) ]
>>> data = numpy.array([[e[1] for e in x], [e[2] for e in x]])
>>> numpy.corrcoef(data)
array([[ 1.        ,  0.99339927],
       [ 0.99339927,  1.        ]])

Answer 4

使用numpy：

from numpy import *
v = [ ('k', 1, 2), ('l', 2, 4), ('m', 13, 9) ]
corrcoef([ a[1] for a in v ], [ a[2] for a in v ])[0,1]

Answer 5

我会推荐pandas库http://pandas.sourceforge.net/generated/pandas.DataFrame.corr.html?highlight=corr#pandas.DataFrame.corr