[英]R (64-bit on Windows): How to get around "cannot allocate vector of size 557.6 Mb" error in code
[英]Cannot allocate vector in R despite being in 64-bit version
我正试图在R中做一个dcast来生成一个矩阵,如我问的另一个问题所示
但是,我收到一个错误:
错误:无法分配大小为2.8Gb的向量。
我的桌面有8GB的RAM,我正在运行ubuntu 11.10 64位版本。 我可能使用了错误的R版本吗? 我怎么知道,有没有办法在运行R时确定它? 我当然必须有足够的空间来分配这个载体。
错误消息意味着R需要分配另外 2.8Gb的内存来完成您尝试执行的任何操作。 这并不意味着它需要分配2.8Gb的最大值。 在运行R代码的同时在shell中运行top
并观察R如何占用内存,直到它划分出额外的2.8Gb地址空间不可用的点。
你的盒子上有一个大的交换空间吗? 我可以很容易地看到你正在做什么使用所有8Gb的RAM加上你所有的交换空间,所以R没有其他地方可以从中获取内存空间,从而抛出错误。
也许您可以尝试以块的形式进行dcast,或尝试使用替代方法而不是使用dcast。 如果您需要帮助,请发布另一个Q.
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