[英]How to call an object with the character variable of the same name
我正在尝试在 R 中编写一个函数来以类似的方式批量分析多个文件。 这些文件属于ExpressionSetIllumina
类。 我可以使用目录中所有文件的名称创建一个字符(字符串)向量并加载每个文件:
list = list.files()
for (i in list[1]) {
load(i)
}
这正确加载文件
> ls()
[1] "i" "list" "SSD.BA.vsn"
> class(SSD.BA.vsn)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"
我现在想要做的是使用i
(字符串"SSD.BA.vsn"
)将对象SSD.BA.vsn
分配给新的对象数据,以便:
>data = SomeFunction(i)
>class(data)
[1] "ExpressionSetIllumina"
attr(,"package")
[1] "beadarray"
但是到目前为止,无论我尝试过什么,都只是将数据作为与 i 具有相同值的字符向量返回,或者根本不起作用。 所以我想知道是否有一个函数可以为我做这件事,或者我是否需要以其他方式去做。
我将对象或变量的名称存储为字符向量中的字符串。 如何使用字符串对象名称对对象执行某些操作?
我想你想要get
。
data <- get(i)
也就是说,一旦你开始使用get
(及其对应物, assign
),你通常会得到可怕的不可读代码。
对于像您这样的批量分析,通常最好将所有数据读入数据框列表,然后自由使用lapply
。 就像是:
data_files <- list.files()
all_vars <- lapply(data_files, function(file)
{
vars_loaded <- load(file)
mget(vars_loaded, parent.frame())
})
mget
是一次检索多个变量的get
版本。 在这里它用于检索通过调用加载加载的所有内容。
现在您有一个列表列表:顶级列表与文件相关,低级列表包含从该文件加载的变量。
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