來自命令行的R腳本

Question

我想從Windows命令行運行此示例腳本： http ： //mazamascience.com/WorkingWithData/？p = 912 。 所以我打開命令行並鍵入Rscript tryCatch.R 1 。 但是，我一直收到錯誤消息Error: R not found 。 我確實將PATH環境變量設置為C:\\Programme\\R\\R-3.0.1\\bin 。 如果我只輸入R.exe ，它確實啟動R ，但它找不到要在開始時加載的package 'utils' in options<"defaultPackages"> was not found （例如package 'utils' in options<"defaultPackages"> was not found ）。 我想我必須在某處設置另一條通往圖書館的路徑，但我不知道該在哪里做。

更新：顯式鍵入PATH C:\\Programme\\R\\R-3.0.1\\bin （而不是僅將其添加到環境變量PATH的值）后，似乎找到了R 但是，出現了一個新問題： In normalizePath<path.expand(path), winslash, mustWork>: path[2] = "C:/Programme/R/R-3.0.1/library": Access denied ，相同對於methods庫。 然后： Calls: .First ... library -> .getRequiredPackages2 -> library -> normalizePath Execution stopped 。 我使用的是Windows 7，但我確實擁有管理員權限。

Answer 1

Rscript非常方便（ R CMD BATCH是舊方法）特別是在windows下，但一般在我創建批處理文件以避免所有路徑的頭痛。

比如說launcher.bat：

@echo off
C:
PATH C:\Programme\R\R-3.0.1\bin;%path%
cd PATH_TO_YOUR_RSCRIPT
Rscript tryCatch.R 1
pause

並打開一個控制台（使用cmd），轉到存儲launcher.bat的位置並啟動它。 或者從使用shell的R cosnole：

shell('path_to_launcher\launcher.bat')

Answer 2

我發現它是Windows 7上特定於語言的問題，與此處描述的類似： https ： //stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2011-May/276932.html

將PATH更改為C:\\Program Files\\R\\R-3.0.1\\bin ，腳本將從命令提示符正確執行。

感謝所有試圖幫助的人！

Answer 3

我在Windows 7下遇到了這個問題，顯然，當設置環境變量>用戶變量時，路徑沒有添加到PATH中，因此用戶必須在系統變量> PATH中添加此路徑，最后只需添加.EXE的路徑文件和瞧。