R : 使用 ggplot2 部分顯示的置信區間（使用 geom_smooth()）

Question

我有以下簡單的 R 代碼：

disciplines <- c("A","C","B","D","E")
# To stop ggplot from imposing alphabetical ordering on x-axis
disciplines <- factor(disciplines, levels=disciplines, ordered=T)

d1 <- c(0.498, 0.521, 0.332, 0.04, 0.04)
d2 <- c(0.266, 0.202, 0.236, 0.06, 0.06)
d3 <- c(0.983, 0.755, 0.863, 0.803, 0.913)
d4 <- c(0.896, 0.802, 0.960, 0.611, 0.994)

df <- data.frame(disciplines, d1, d2, d3, d4)
df.m <- melt(df)
graph <- ggplot(df.m, aes(group=1,disciplines,value,colour=variable,shape=variable)) +
         geom_point() +
         geom_smooth(stat="smooth", method=loess, level=0.95) +
         scale_x_discrete(name="Disciplines") +
         scale_y_continuous(limits=c(-1,1), name="Measurement")

輸出如下所示：

為什么置信區間不顯示在整條曲線上？

注意事項：

1. 我不想讓fullrange=TRUE因為這只會在當前輸出中產生一條藍色直線而不是鋸齒形。
2. 我正在將此圖與另一個在 (0,-1] 范圍內具有負值的圖進行比較，這就是為什么 y 軸具有limits=c(-1,1) )

Answer 1

對於置信區間的前三個部分，范圍的頂端至少部分超出范圍（范圍是 [-1, 1]，而不是軸上略微擴大的范圍）。 ggplot的默認行為是不顯示任何部分越界的對象。 您可以通過將oob=scales::rescale_none添加到scale_y_continuous來解決此scale_y_continuous ：

library(scales)
graph <- ggplot(df.m, aes(group=1,disciplines,value,colour=variable,shape=variable)) +
         geom_point() +
         geom_smooth(stat="smooth", method=loess, level=0.95) +
         scale_x_discrete(name="Disciplines") +
         scale_y_continuous(limits=c(-1,1), name="Measurement", oob=rescale_none)

Answer 2

一個更好的文檔，也許更直觀的解決方案是簡單地使用coord_cartesian ：

ggplot(df.m, aes(group=1,disciplines,value,colour=variable,shape=variable)) +
         geom_point() +
         geom_smooth(stat="smooth", method=loess, level=0.95) +
         scale_x_discrete(name="Disciplines") +
         coord_cartesian(ylim = c(-1,1))