[英]Select rows by criteria in another data.frame without for loop in R
這與問題有關: 如何從一個數據框中提取行(使用循環)並將其保存在另一個數據框中
如果ddf的“ POS”位於refdf的“開始”和“結束”之間,則需要將其包含在與ddf具有相同結構的outdf中。 我可以使用“ for”循環來管理它,但是可以不使用“ for”循環來完成它嗎?
ddf = structure(list(POS = c(23L, 48L, 5L), Freq1 = c(0.5, 0.7, 0.8
), Freq2 = c(0.45, 0.55, 0.65)), .Names = c("POS", "Freq1", "Freq2"
), class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L))
refdf = structure(list(Start = c(1L, 25L, 60L), End = c(10L, 50L, 75L
)), .Names = c("Start", "End"), class = "data.frame", row.names = c(NA,
-3L))
ddf
# POS Freq1 Freq2
#1 23 0.5 0.45
#2 48 0.7 0.55
#3 5 0.8 0.65
refdf
# Start End
#1 1 10
#2 25 50
#3 60 75
outdf = data.frame(POS=numeric(), Freq1=numeric(), Freq2=numeric())
for(i in 1:nrow(ddf)) for(j in 1:nrow(refdf)){
if(ddf[i,1]>refdf[j,1] && ddf[i,1]<refdf[j,2])
{outdf[nrow(outdf)+1,] = ddf[i,]; next}
}
outdf
# POS Freq1 Freq2
#2 48 0.7 0.55
#3 5 0.8 0.65
我嘗試了以下操作,但不起作用:
apply(ddf,1,function(x){print(x);ifelse(x[1]>refdf$Start & x[1]<refdf$End, x,"")})
對於大問題,這在空間上並不是特別有效,但不適for
:
ddf[ddf$POS %in% unlist(apply(refdf, 1, function(x) seq(x[1],x[2]))),]
## POS Freq1 Freq2
## 2 48 0.7 0.55
## 3 5 0.8 0.65
POS
所有允許值均由unlist(apply)
表達式計算。 當然,這假定POS
僅包含整數值。
這是一種方法。 它不需要整數值,但也不會特別有效:
pow <- cbind(expand.grid(ddf$POS, refdf$Start), Var3=expand.grid(ddf$POS, refdf$End)$Var2)
boom <- pow[which(pow$Var1 > pow$Var2 & pow$Var1 < pow$Var3), 'Var1']
ddf[ddf$POS %in% boom, ]
# POS Freq1 Freq2
#2 48 0.7 0.55
#3 5 0.8 0.65
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