將大量點寫入vtk文件格式

Question

我正在用python編寫腳本，該腳本正在解析約500張寬度為1810px且高度為1808px的圖像（3d對象的切片）。 我想從所有這些圖像中寫入點（使用原始顏色）並將其保存為vtk文件格式。 為了測試目的，我從vtk修改了示例：

import vtk
from vtk import *

#setup points and vertices
Points = vtk.vtkPoints()
Vertices = vtk.vtkCellArray()

for x in xrange(0, 1808):
    for y in xrange(0, 1810):
        for z in xrange(0, 544):
            id = Points.InsertNextPoint(x, y, z)
            Vertices.InsertNextCell(1)
            Vertices.InsertCellPoint(id)


polydata = vtk.vtkPolyData()
polydata.SetPoints(Points)
polydata.SetVerts(Vertices)
polydata.Modified()
if vtk.VTK_MAJOR_VERSION <= 5:
    polydata.Update()

writer = vtk.vtkXMLPolyDataWriter()
writer.SetFileName("TriangleColoredPoints.vtp")
if vtk.VTK_MAJOR_VERSION <= 5:
    writer.SetInput(polydata)
else:
    writer.SetInputData(polydata)
writer.Write()

現在它甚至都沒有讀取圖像，但是問題是當我添加所有這些點時，我的內存不足了。 有什么辦法可以將這些點保存為塊嗎？

Answer 1

看起來您正在嘗試以大約1800x1800x500點（約16億點）的大小寫一個多數據。 數以百萬計的可能是有可能的，但數十億美元是不可能的，無論如何還沒有。 看起來您將需要減少問題的大小。 如果確實減小了問題的大小，請使用vtkXMLPolyDataWriter。 它有

writer->SetDataModeToBinary();
writer->SetCompressorTypeToZLib();

這對於將大型模型緊湊地寫入文件系統很有用。

或者，您可以將圖像存儲為上述注釋中提到的單個卷（1800x1800x500，vtkImageData），但是仍然會占用非常大的內存。 然后，您可以進行體繪制或行進立方體以獲取曲面等。但是，如果沒有更多詳細信息，您將嘗試實現目標，那么就很難再回答了。