将大量点写入vtk文件格式

Question

我正在用python编写脚本，该脚本正在解析约500张宽度为1810px且高度为1808px的图像（3d对象的切片）。 我想从所有这些图像中写入点（使用原始颜色）并将其保存为vtk文件格式。 为了测试目的，我从vtk修改了示例：

import vtk
from vtk import *

#setup points and vertices
Points = vtk.vtkPoints()
Vertices = vtk.vtkCellArray()

for x in xrange(0, 1808):
    for y in xrange(0, 1810):
        for z in xrange(0, 544):
            id = Points.InsertNextPoint(x, y, z)
            Vertices.InsertNextCell(1)
            Vertices.InsertCellPoint(id)


polydata = vtk.vtkPolyData()
polydata.SetPoints(Points)
polydata.SetVerts(Vertices)
polydata.Modified()
if vtk.VTK_MAJOR_VERSION <= 5:
    polydata.Update()

writer = vtk.vtkXMLPolyDataWriter()
writer.SetFileName("TriangleColoredPoints.vtp")
if vtk.VTK_MAJOR_VERSION <= 5:
    writer.SetInput(polydata)
else:
    writer.SetInputData(polydata)
writer.Write()

现在它甚至都没有读取图像，但是问题是当我添加所有这些点时，我的内存不足了。 有什么办法可以将这些点保存为块吗？

Answer 1

看起来您正在尝试以大约1800x1800x500点（约16亿点）的大小写一个多数据。 数以百万计的可能是有可能的，但数十亿美元是不可能的，无论如何还没有。 看起来您将需要减少问题的大小。 如果确实减小了问题的大小，请使用vtkXMLPolyDataWriter。 它有

writer->SetDataModeToBinary();
writer->SetCompressorTypeToZLib();

这对于将大型模型紧凑地写入文件系统很有用。

或者，您可以将图像存储为上述注释中提到的单个卷（1800x1800x500，vtkImageData），但是仍然会占用非常大的内存。 然后，您可以进行体绘制或行进立方体以获取曲面等。但是，如果没有更多详细信息，您将尝试实现目标，那么就很难再回答了。