關閉文件后如何將 h5py 組保留在內存中？

Question

關閉文件后如何將 h5py 組保留在內存中？

在以下代碼之后：

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"]

我可以訪問worm_features因為它是一個h5py 組（ <HDF5 group "/worm" (4 members)> ）

但是在我運行這條線之后：

feature_file.close()

我無法再訪問worm_features 。 它現在顯示為<Closed HDF5 group> 。

因為我需要為大約 20 個文件加載 worm_features h5py 組，所以我想在處理我加載到內存中的數據之前關閉這些文件。 這不可能嗎？

Answer 1

使用 .value 從數據集中提取所需的變量。

例子：

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"].value
feature_file.close()
print worm_features

Answer 2

使用[:]將數據集的值復制到變量中，以便在關閉 hdf5 文件后訪問數據集。

import h5py

feature_file = h5py.File(worm_file_path, 'r')
worm_features = feature_file["worm"] [:]
feature_file.close()
print (worm_features)

.value對我不起作用並引發以下錯誤：

AttributeError: 'Dataset' object has no attribute 'value'