如何計算相關值的平均值？

Question

讓我們假設以下向量：

x = c( 0.5, 0.4, 0.8 )

其中 x[1] 和 x[2] 值是相關的，相關矩陣為：

     x[1]  x[2]  x[3]
x[1]  1    0.8    0
x[2]  0.8  1      0
x[3]  0    0      1

我想計算 x 的平均值，但要考慮相關性。

我嘗試使用 lm() 使用廣義最小二乘法，但這意味着使用水平 function，而 lm() 不喜歡使用 poly(x,0)。 我尋找使用用戶定義的function，但它應該返回要擬合的參數......

作為一個具體的例子，讓我們從進化樹中取出三個物種：

library(ape)
## The evolution tree
t=rtree(3)
## Plot it, you notice that two are closer to each other than the 3rd one
plot(t)
## Correlation matrix
vcv.phylo(t,corr=T)
      t1        t3 t2
t1 1.0000000 0.4019544  0
t3 0.4019544 1.0000000  0
t2 0.0000000 0.0000000  1

歡迎任何提示！

Answer 1

答案可以在 CERN 論文中找到：預印本 (HTTPS) 、預印本 (FTP)或已發布的副本。

該過程是廣義最小二乘回歸。

有關結果，請參見第 (1) 頁的公式 (2)。