嘗試在另一台計算機上使用glm模型進行預測時出錯

Question

我想在一台R機器中保存一個glm對象並用它來預測位於另一台有更新數據的機器上的另一台數據集。我嘗試使用save和load但沒有成功。我做錯了什么？ 這是一個玩具示例：

# on machine 1:
glm<-glm(y~x1+x2,data=dat1, family=binomial(link="logit")
save(glm,file="glm.Rdata") # the file is stored in a folder.

# on machine 2:
load(glm.RData) # got an error:"Error in load(glm.RData) : object 'glm.RData' not found"
#I tried :
 load(file='glm.RData') # no error was displayed
  print(glm) # got an error:"Error in load(glm.RData) : object 'glm.RData' not found"

任何幫助都會很棒。

Answer 1

根據@ user3710546的建議，我會避免使用名稱glm來保存你的模型，因為它會掩蓋（即阻塞） glm()函數，這使你很難在你的會話中使用它。

使用save()和load()

save()通常用於將對象列表保存到文件，而不是單個對象。 save()的第一個參數是list ，'包含要保存的對象名稱的字符向量'。 （強調我的。）所以你想要像這樣使用它：

# On machine 1:
save(list = 'glm', file = '/path/to/glm.RData')

# On machine 2:
load(file = '/path/to/glm.RData')

請注意，文件擴展名通常區分大小寫：您保存到擴展名為.RData的文件，但是從擴展名為.Rdata的文件加載，這是不同的。 這可以解釋為什么找不到該文件。

使用saveRDS()和readRDS()

使用save()和load的另一種方法是使用saveRDS()和readRDS() ，它們被設計用於一個對象。 它們的使用方式略有不同：

# On machine 1
saveRDS(glm, file = '/path/to/glm.rds')

# On machine 2
glm = readRDS(file = '/path/to/glm.rds')

請注意.rds文件擴展名以及readRDS()不會自動放入環境中的事實（需要將其分配給某些內容）。

保存GLM的部分內容

如果你只想保存公式 - 即實際的文本字符串 - 你可以在glm$formula找到它，其中glm是你的對象的名字。 它作為formula對象返回，但您可以將其轉換為帶有as.character(glm$formula)的字符串，然后將其寫入文本文件或其他任何內容。

但是，如果您希望模型本身沒有創建數據集（以減少磁盤空間），請查看本文 ， 該文章討論了可以安全刪除glm對象的哪些部分。