尝试在另一台计算机上使用glm模型进行预测时出错

Question

我想在一台R机器中保存一个glm对象并用它来预测位于另一台有更新数据的机器上的另一台数据集。我尝试使用save和load但没有成功。我做错了什么？ 这是一个玩具示例：

# on machine 1:
glm<-glm(y~x1+x2,data=dat1, family=binomial(link="logit")
save(glm,file="glm.Rdata") # the file is stored in a folder.

# on machine 2:
load(glm.RData) # got an error:"Error in load(glm.RData) : object 'glm.RData' not found"
#I tried :
 load(file='glm.RData') # no error was displayed
  print(glm) # got an error:"Error in load(glm.RData) : object 'glm.RData' not found"

任何帮助都会很棒。

Answer 1

根据@ user3710546的建议，我会避免使用名称glm来保存你的模型，因为它会掩盖（即阻塞） glm()函数，这使你很难在你的会话中使用它。

使用save()和load()

save()通常用于将对象列表保存到文件，而不是单个对象。 save()的第一个参数是list ，'包含要保存的对象名称的字符向量'。 （强调我的。）所以你想要像这样使用它：

# On machine 1:
save(list = 'glm', file = '/path/to/glm.RData')

# On machine 2:
load(file = '/path/to/glm.RData')

请注意，文件扩展名通常区分大小写：您保存到扩展名为.RData的文件，但是从扩展名为.Rdata的文件加载，这是不同的。 这可以解释为什么找不到该文件。

使用saveRDS()和readRDS()

使用save()和load的另一种方法是使用saveRDS()和readRDS() ，它们被设计用于一个对象。 它们的使用方式略有不同：

# On machine 1
saveRDS(glm, file = '/path/to/glm.rds')

# On machine 2
glm = readRDS(file = '/path/to/glm.rds')

请注意.rds文件扩展名以及readRDS()不会自动放入环境中的事实（需要将其分配给某些内容）。

保存GLM的部分内容

如果你只想保存公式 - 即实际的文本字符串 - 你可以在glm$formula找到它，其中glm是你的对象的名字。 它作为formula对象返回，但您可以将其转换为带有as.character(glm$formula)的字符串，然后将其写入文本文件或其他任何内容。

但是，如果您希望模型本身没有创建数据集（以减少磁盘空间），请查看本文 ， 该文章讨论了可以安全删除glm对象的哪些部分。