[英]R apply custom vectorised function to row in dataframe, specific columns
這應該很簡單,但我無法apply
與我的矢量化函數進行通信。
測試數據為: df <- data.frame(a = 1:3, b1 = c(4:5, NA), b2 = c(5,6,5))
看起來像這樣:
a b1 b2
1 1 4 5
2 2 5 6
3 3 NA 5
自定義函數檢查返回一個向量以指示值是否落在給定的區間內。
validScore <- function(x, a, b) {
is.na(x) == FALSE &
x%%1 == 0 &
findInterval(x, c(a,b), rightmost.closed = TRUE) == 1
}
自定義函數的測試: validScore(c(3, 3.5, 6, NA), 1, 5)
按預期返回邏輯向量TRUE FALSE FALSE FALSE
。
我想在 b1 和 b2 列定義的行上運行自定義函數。 這將返回 TRUE FALSE FALSE(即 T on (b1=4,b2=5),F on (b1=5,b2=6) 和 F on (b1=NA,b2=5))。
答案Call apply-like function on each row of dataframe with multiple arguments from each row to select the columns,以及如何將函數應用於 R 中矩陣(或數據框)的每一行,共同提出以下建議:
library(dplyr)
apply(select(df, b1:b2), 1, function(x) validScore(x, 1, 5))
但這實際上並沒有將行發送到函數,而是單獨評估每個值,因此輸出是:
[,1] [,2] [,3]
b1 TRUE TRUE FALSE
b2 TRUE FALSE TRUE
像select(df, b1:b2) %>% rowwise() %>% apply(1, function(x) validScore(x, 1, 5))
一樣將 rowwise() 插入中間沒有區別。
我認為這可能與 dplyr select 返回的形式有關,但是apply(df[, c("b1", "b2")], 1, function(x) validScore(x, 1, 5))
也會產生同樣的結果。
你不需要dplyr
或plyr
。 你可以只使用基礎 R。
首先要做的是讓validScore
只返回一個TRUE
或FALSE
。 這可以使用all
函數完成
validScore <- function(x, a, b) {
test = is.na(x) == FALSE &
x %% 1 == 0 &
findInterval(x, c(a,b), rightmost.closed = TRUE) == 1
all(test)
}
之后只需使用標准apply
## Select columns 2 & 3
apply(df[, 2:3], 1, validScore, a=1, b=8)
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