[英]dist() function in R outputs
我很好奇我得到的dist()輸出結果。 更具體地說,如果我嘗試
a=matrix(rnorm(1:100),nrow=10)
dist(a)
好的,我得到了我的預期
1 2 3 4 5 6 7 8 9
2 3.700582
3 3.793826 4.391523
4 3.063703 5.386797 5.494179
5 3.205545 4.464493 3.839944 3.763671
6 3.868796 4.954696 3.340530 5.165389 3.589912
7 3.906698 3.971069 3.405455 5.403859 4.284414 4.774963
8 2.620238 4.479064 5.403749 3.128820 4.237437 5.272889 5.551908
9 3.645784 4.586749 5.508289 3.333739 4.318391 6.113694 4.796519 3.641355
10 2.292591 4.152536 4.869231 3.445773 3.557222 3.992109 4.061925 3.740496 4.225799
很好,但是:當我有一個更大的矩陣
dim(Large_m)
[1] 978 235
我試試
a=dist(Large_m)
Rstudio說,我沒有得到矩陣,而是一個“大型”對象。
如果我和as.matrix
一起使用它是否正確?
b=as.matrix(a)
b我檢查確實是一個矩陣,看起來像距離矩陣。
另外,我真的需要距離矩陣中的行名,而不僅僅是數字,但這樣(使用as.matrix
)我無法得到它。
似乎我錯過了一些東西,不能在R中創建一個距離矩陣那么復雜。
這是@ColonelBeauvel在評論中建議的一個明確的例子。 (我認為由於評論中的拼寫錯誤導致了一些混亂:as.matrix()vs is.matrix()...)
大隨機矩陣:
cols <- 325
rows <- 978
m <- matrix(rnorm(1:(rows*cols)), ncol=cols)
讓我們給行和列命名:
rownames(m) <- paste0("r", 1:rows)
colnames(m) <- paste0("c", 1:cols)
使用dist
計算距離對象,然后將其轉換為帶有as.matrix
的常規矩陣(由Beauvel上校建議):
d <- dist(m)
dm <- as.matrix(d)
檢查類型:
class(d)
[1] "dist"
class(dm)
[1] "matrix"
名稱保存在距離矩陣dm中。 這是它的一小部分:
dm[1:3,1:3]
r1 r2 r3
r1 0.00000 24.64059 26.63301
r2 24.64059 0.00000 25.69792
r3 26.63301 25.69792 0.00000
希望這可以幫助。
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