[英]R extracting lists within dataframes
解析嵌入在數據框中變量中的列表的最佳方法是什么?
在 R 中解析 json 時(我通常使用 jsonlite 包),我經常最終得到包含列表(其他列表或數據框的)的數據框列。 一個簡單的例子是解析 Twitter 流數據,其中坐標作為緯度和經度列表返回。 一個更復雜的例子(也是我目前正在處理的那個)是醫生的 JSON,它將地址解析為數據幀列表。 這是一些說明結構的示例數據(順便說一下,這是公共數據):
> str(df)
Classes ‘tbl_df’ and 'data.frame': 2 obs. of 2 variables:
$ addresses:List of 2
..$ :'data.frame': 1 obs. of 6 variables:
.. ..$ address : chr "Department of Palliative Care"
.. ..$ address_2: chr "2525 Cumberland Parkway, SE"
.. ..$ city : chr "Atlanta"
.. ..$ state : chr "GA"
.. ..$ zip : chr "30305"
.. ..$ phone : chr "4043650966"
..$ :'data.frame': 2 obs. of 6 variables:
.. ..$ address : chr "5445 Meridian Mark Road" "3619 South Fulton Avenue"
.. ..$ address_2: chr "Suite 370" ""
.. ..$ city : chr "Atlanta" "Hapeville"
.. ..$ state : chr "GA" "GA"
.. ..$ zip : chr "30342" "30354"
.. ..$ phone : chr "4047652020" "4047652020"
$ npi : chr "1497831390" "1578667986"
jsonlite 有一個函數 (flatten) 用於將嵌入的數據幀提取到單個變量,但它不適用於列表。
在 Twitter 示例中,我可以使用 for 循環將列表項提取到同一數據幀中的變量:
for (i in 1:nrow(df)){
#sometimes coordinates is blank, so check
if (length(df2$coordinates.coordinates[[i]]>0)){
df2[i,"coordinates.lon"]<- df2$coordinates.coordinates[[i]][1]
df2[i,"coordinates.lat"]<- df2$coordinates.coordinates[[i]][2]
}
在 Doctor 示例中,由於每個 Doctor 可以有多個地址,因此我需要創建一個新數據集。
library(dplyr)
addresses = data.frame()
for (i in 1:nrow(df)){
x<-df$addresses[[i]]
#need an identifier
x$id <-df[[i,"npi"]]
addresses <-bind_rows(addresses, x)
}
雖然這兩個例子都有效,但它們都 a) 緩慢且 b) 不是“R”的做事方式(據我所知)。
所以,我的問題是:從數據框變量中提取列表的更好、更快、更“R”的方法是什么?
感謝理查德·斯克里文。 unnest
in tidr
正是我所需要的。
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