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[英]How to plot a Complementary Cumulative Distribution Function (CCDF) in R (preferbly in ggplot)?
[英]R and ggplot - plot distribution and line
我有一個看起來很簡單的問題,但似乎無法弄清楚。 我有一個給定年份的治療數據集。 有3種不同的治療方法。 我想創建兩個圖:
看起來像這樣的一個:
看起來像這樣的一個:
,除了,我想堆疊多種處理方式(三種而不是示例中的一種)。
假設我們有以下df:
y=c(2001,2001,2001,2001,2002,2002,2002,2003,2003,2003,2003,2004,2004)
t=c("a","a","b","c","a","a","b","c","a","a","b","c","b")
df=data.frame(y,t)
我試過使用
geom_plot()
但這行不通。 我可以讓R最接近地為我做比例的是使用來自另一篇文章的代碼的以下堆疊直方圖:
p+geom_histogram(aes(y=..density.., color=t , fill=t))
對於顯示的圖表類型,在繪制之前需要計算比例。 table
功能可用於按年和t
對t
進行計數。 ave
with sum
by y
然后計算比例的年度總和。 您的第一個圖是用geom_area
而第二個是標准線和點圖。 代碼看起來像
library(ggplot2)
y=c(2001,2001,2001,2001,2002,2002,2002,2003,2003,2003,2003,2004,2004)
t=c("a","a","b","c","a","a","b","c","a","a","b","c","b")
df=data.frame(y, t)
# Count number of t's by year
df_tab <- as.data.frame(table(df), stringsAsFactors=FALSE)
# convert counts to percents
df <- data.frame(df_tab, p=df_tab$Freq/ave(df_tab$Freq, df_tab$y, FUN=sum))
df$y <- as.numeric(df$y)
# Set plot colors and themes
plot_colours <- c(a="red3", b = "orange", c = "blue")
plot_theme <- theme(axis.title = element_text(size = 18 )) +
theme(axis.text = element_text(size = 18)) +
theme(legend.position="top", legend.text=element_text(size=18))
# make area plot
sp <- ggplot(data=df, aes(x=y, y= 100*p, fill=t)) + geom_area()
sp <- sp + scale_fill_manual(values=plot_colours)
sp <- sp + labs(x="Year", y = "Percentage of Patients")
sp <- sp + plot_theme
plot(sp)
# make line plot
sp <- ggplot(data=df, aes(x=y, y=p, colour=t))
sp <- sp + geom_line(aes(ymax=1), position="stack", size=1.05) + geom_point(aes(ymax=1), position="stack", size=4)
sp <- sp + scale_colour_manual(values=plot_colours)
sp <- sp + labs(x="Year", y = "Proportion Receiving Treatment")
sp <- sp + plot_theme
plot(sp)
和
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