R中比例差異的置信區間

Question

我正在尋找一種快速的方法（不創建太多新的數據框）用於以下操作：

想象一下，我有兩個變量： data$occupation （行，從上到下，從“ 1”到“ 4”），以及data$disease （列，從左到右，“是”和“否”），其中包含以下數據：

mat1<-matrix(c(54,23,28,45,16,10,17,13), 4,2)

我想得出一個表格，其中包含“職業”不同類別中“是”的比例，職業之間的比例差異百分比和該差異的置信區間：

使用prop.test(table(data$occupation, data$disease), correct=FALSE) ，我得到了不同的比例，但是現在我想找到一個突擊隊，它給出了比例之間的差異（參考我可以輸入）和相關CI。

像twoby2() （給出OR和RR）之類的東西會很好。

Answer 1

我是統計方面的新手，但是關於此發布 ，我會嘗試這樣

tab <- table(data$occupation, data$disease)
combinations <- t(combn(nrow(tab), 2))
cbind(combinations, t(apply(combinations, 1, function(rows) {
  re <- prop.test(x=tab[rows, 1], n=rep(nrow(data), 2), correct=F)
  re$estimate <- unname(re$estimate)
  return(c(
    propY1 = re$estimate[1], 
    propY2 = re$estimate[2],
    diff = re$estimate[1]-re$estimate[2], 
    l = re$conf.int[1],
    u = re$conf.int[2]
  ))
})))
#             propY1    propY2        diff           l           u
# [1,] 1 2 0.2621359 0.1116505  0.15048544  0.07661756  0.22435331
# [2,] 1 3 0.2621359 0.1359223  0.12621359  0.05007540  0.20235179
# [3,] 1 4 0.2621359 0.2184466  0.04368932 -0.03871570  0.12609434
# [4,] 2 3 0.1116505 0.1359223 -0.02427184 -0.08783067  0.03928698
# [5,] 2 4 0.1116505 0.2184466 -0.10679612 -0.17774178 -0.03585045
# [6,] 3 4 0.1359223 0.2184466 -0.08252427 -0.15583081 -0.00921773