無法安裝h5py

Question

我正在嘗試安裝h5py ，但是當我執行pip install h5py或使用python setup.py install從源代碼時，出現致命錯誤：

hdf5.h: No such file or directory.

其他帖子提到執行pip install libhdf5-dev或pip install libhdf5-serial-dev來解決這個問題，但它說“找不到匹配的發行版”。

如何安裝 h5py？ 我使用 CentOS 6.5 版本的 Linux 連接到 Odyssey 計算機。此外，我沒有 sudo 權限。 謝謝！

Answer 1

您的錯誤是因為您缺少hdf5.h標頭， pip不會安裝開發標頭，您需要使用軟件包管理器安裝它們，在Centos上它將是：

yum install hdf5-devel

如果你看一下安裝內容：

Linux和OS X上的源安裝

你需要，通過apt-get，yum或Homebrew：

帶有開發頭的Python 2.6,2.7,3.3或3.4（python-dev或類似）

具有開發標頭的HDF5 1.8.4或更高版本的共享庫版本（libhdf5-dev或類似版本）

NumPy 1.6.1或更高版本

Answer 2

這個鏈接幫助： https ： //github.com/Homebrew/legacy-homebrew/issues/23144

我安裝了LinuxHomeBrew並做了：

brew tap homebrew/science
brew install hdf5
pip install h5py 

我能夠安裝h5py！

Answer 3

sudo apt-get update

sudo apt-get install python-h5py

（ 來源 ）

Answer 4

運行以下命令解決了我的問題，因為我遇到了與xlocale.h相關的錯誤

sudo ln -s /usr/include/locale.h /usr/include/xlocale.h

Answer 5

另外，不是pip install libhdf5-dev或pip install libhdf5-serial-dev ，而是apt install libhdf5-dev和apt install libhdf5-serial-dev 。 然后，運行pip install h5py