在循環中連接不同長度的字符串

Question

我正在嘗試從這種格式轉換文件：

# SampleNamea   seq1a   seq2a
# SampleNameb   seq1b   seq2b
# SampleNamec   seq1c   seq2c
# SampelNamed   seq1d   seq2d

對於這種格式：

# SampleNamea   SampleNameb 0   0   0   0   s   s   e   e   q   q   1   1   a   b   s   s   e   e   q   q   2   2   a   b
# SampleNamec   SampleNamed 0   0   0   0   s   s   e   e   q   q   1   1   c   d   s   s   e   e   q   q   2   2   c   d

目前我的腳本如果seq1a ， seq1b等長度相同。 但是在數據集中我的字符串長度各不相同。 如果我嘗試在我的數據集上運行腳本， IndexError: string index out of range收到消息IndexError: string index out of range 。

這是腳本的一部分：計算出附加到InputMasterList中的字符串長度（即seq1aseq2a ， seq1bseq2b ），將帶有額外零的SampleName s添加到OutputMasterList 。 然后它應該附加到OutputMasterList通過選擇開始元素[0]從每個連續元件的串InputMasterList[LineEven]串（ seq1aseq2a ）和InputMasterList[LineOdd]串（ seq1bseq2b ）和它們放在一起分組到OutputMasterList 。 所以結果將是（ sseeqq 1 1 absseeqq 2 2 ab ）。

如何讓這個腳本在不同的字符串長度上工作？

LineEven = 0
LineOdd = 1
RecordNum = 1

while RecordNum < (NumofLinesInFile/2):
    for i in range(len(InputMasterList[LineEven])):
        if i == 0:
            OutputMasterList.append(SampleList[LineEven]+'\t'+ SampleList[LineEven]+'\t'+'0'+'\t'+'0'+'\t'+'0'+'\t'+'0'+'\t')
        OutputMasterList[RecordNum] = InputMasterList[LineEven][i]+'\t'+InputMasterList[LineOdd][i]+'\t'
    RecordNum = RecordNum + 1
    LineEven = LineEven + 2
    LineOdd = LineOdd + 2

我是一個非常初學者，所以我知道這段代碼非常繁瑣，但任何幫助都將不勝感激。 如果您需要澄清我試圖用這個腳本做什么，請不要猶豫。

更新：感謝您的及時回復。 由於您的反饋，我意識到我必須改變我的問題的性質。 在我的數據集中，我缺少了我的腳本不喜歡的序列，我需要使用占位符來解釋這個缺失的數據，占位符與其對應的長度相同。

舊格式：

# SampleNamea   seq1a   seq2a

# SampleNameb   '.'      seq2b

新格式：

# SampleNamea   seq1a   seq2a

# SampleNameb   NNNNN   seq2b

然后我相信我的腳本會起作用！

TL; DR - 根據您的反饋，我的基礎是我的下一步應該是什么。

Answer 1

根據您的新更新，InputMasterList [LineOdd]字符串可能看起來像（.seq2b）。

然后在繼續追加之前，檢查InputMasterList

if '.' in InputMasterList[LineOdd]:
    InputMasterList[LineOdd] = InputMasterList[LineOdd].replace('.', 'NNNNN', 1)

您可以為LineOdd和LineEven執行此操作

注意 ：這取決於您的新輸入