R循環，用於匹配的data.table列

Question

我真的很難創建一個運行模型的函數，其中所有變量a ， b ， d ， g和N都有多個版本，如data.table中所示，在下面我將其命名為crm ：

crm = data.table(
  East = 26500,
  North = c(115000, 120000, 125000, 130000, 135000, 140000), 
  rain = c(1049.61, 1114.31, 1361.61, 1407.2, 1499.56, 1654.13), 
  crop = 'Wheat', area = c(0.1718, 0.1629, 0.1082, 0.0494, 0.02, 0.004), 
  rn = c("10007", "10018", "10023", "10024", "10025", "10026"), 
  N1 = 184.262648839489, N2 = 180.312874871521, N3 = 178.615847839997,
  N4 = 182.531626054579, a1 = 0.186117715072018, a2 = -0.0232731908915799,
  a3 = 0.227017532149122, a4 = 0.162943230565506, b1 = 0.000478900233700419,
  b2 = 0.000787931973696371, b3 = 0.000458478256537521, b4 = 0.000517304324750896,
  d1 = -0.000328164576390286, d2 = -0.000112122093240884, d3 = 0.000112702113716146,
  d4 = 7.40875908059628e-05, g1 = 4.04709473710477e-06, g2 = 3.68724096485995e-06,
  g3 = 3.47214450131546e-06, g4 = 3.55825543257538e-06, key = 'rn'
)

我想做的是運行下面的函數來計算lnN的值，並將其放入與標題中與輸入模型的變量具有相同編號的列中。 即使用a1 ， b1 ， d1 ， g1和N1將生成lnN1列，依此類推，對於所有2s，3s和4s。

n <- 1:4
cols <- paste0("lnN",n)
for(i in 1:length(n)){
crm[,(cols) := lapply(.SD ,function (x) {
  N = crm[,7+i]
  a = crm[,11+i]
  b = crm[,15+i]
  d = crm[,19+i]
  g = crm[,23+i]
a + (b*crm[,rain]) + (g*N) + (d*crm[,rain]*N)}), .SDcols = paste0("N",n)]

}

我還沒有找到有關如何完成此操作的示例。 我嘗試使用mapply但看不到如何在每個變量的所有迭代中迭代mapply。 謝謝您的幫助！

Answer 1

怎么樣：

library(dplyr)
cbind(crm, do.call(cbind, 
  lapply(1:4, function(x) {
    select(crm, c(contains(as.character(x)), rain)) %>% 
      setnames(gsub("[0-9]", "", names(.))) %>%
      transmute(lnN = a + (b*rain) + (g*N) + (d*rain*N)) %>%
      setnames(paste0("lnN", x))
  })
))

主要思想是，對於每個數字，僅選擇包含該數字的列（還包括rain ），重命名這些列以刪除數字，應用公式，重命名結果列以附加該數字，然后將結果cbind到原始表。

Answer 2

因此，看了上面的評論后，我發現嘗試將迭代次數更改為數千時可能會出現問題，因為Frank和Weihuang都建議我重新考慮如何構造數據。

相反，我要做的是將隨機生成的變量矩陣保留為單獨的數據框。 e包含多元隨機值a ， b ， g ＆ d與N （現在稱為Nit ）在rnm 。 因此， crm現在只有前六列。 代碼如下：

for(i in 1:n){
  a = e[1,i]
  b = e[2,i]
  g = e[3,i]
  d = e[4,i]
Nit = rnm[i]
bob = a + (b*crm$rain) + (g*Nit) + (d*crm$rain*Nit)
data.y <- cbind(data.y, bob)
}
crm <- cbind(crm, data.y)
names(crm)[c(7:n)] = names(bobs)

對於1：n的每次迭代，它將讀取每個參數的i值（所有1s，所有2s等），並將其放入模型中，並創建一個名為bob的列。 然后將bob合並到我在函數（ data.y ）之前創建的空數據框中。 這樣循環直到達到所需的循環次數。

然后，我使用cbind將兩者合並在一起，然后使用存儲在數據框bobs中的名稱順序重命名所有bob列，該數據幀包含從.csv文件讀取的列標題為bob.1到bob.n的列標題的列表我用Excel制作。

Answer 3

這里有一個melt -和- dcast （ recast ）版本借力新實施的功能melt的patterns利用提供的名稱。 有關說明，請參閱安裝Wiki ，因為這是當前正在開發中的功能。

library(data.table) 1.10.5+
# create character version of 1:N (Number of output columns)
N = paste0(seq_len(length(grep('^b', names(crm)))))
# join crm to a melt & recast version of itself using rain as 
#   the join key (note this will fail if the amount of rain may
#   not be unique -- in this case, we should include some ID in
#   id.vars, like rn, and adjust accordingly)
crm = crm[crm[ , melt(.SD, id.vars = 'rain', 
                      measure.vars = patterns(N = '^N[0-9]', a = '^a[0-9]', 
                                              b = '^b', d = '^d', g = '^g'))
               # use the formula to generate ln
               ][ , ln := a + b*rain + g * N + d * rain * N
                  # reshape wide
                  ][ , dcast(.SD, rain ~ variable, value.var = 'ln')
                     # rename the columns here
                     ][ , setnames(.SD, N, paste0('ln', N))],
          on = 'rain']

# by-reference version
crm[crm[ , melt(.SD, id.vars = 'rain', 
                measure.vars = patterns(N = '^N[0-9]', a = '^a[0-9]', 
                                        b = '^b', d = '^d', g = '^g'))
         # use the formula to generate ln
         ][ , ln := a + b*rain + g * N + d * rain * N
            # reshape wide
            ][ , dcast(.SD, rain ~ variable, value.var = 'ln')],
    # mget tends to be sort of slow, which is why I used the
    #   assign-by-copy approach first above; in larger examples,
    #   this slow-down may be outweighed by the cost of copying
    paste0('ln', N) := mget(N), on = 'rain']