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循環繪制ggplot中的幾個擬合曲線?

[英]loop to plot several fitted curves in ggplot?

在這個數據集中,我有一個因子,該因子具有3個水平(iso)和兩個連續變量(temp和diam)

library(ggplot2)
library(nlme)

zz <-(" iso temp diam
 Itiquira   22  5.0
 Itiquira   22  4.7
 Itiquira   22  5.4
 Itiquira   25  5.8
 Itiquira   25  5.4
 Itiquira   25  5.0
 Itiquira   28  4.9
 Itiquira   28  5.2
 Itiquira   28  5.2
 Itiquira   31  4.2
 Itiquira   31  4.0
 Itiquira   31  4.1
 Londrina   22  4.5
 Londrina   22  5.0
 Londrina   22  4.4
 Londrina   25  5.0
 Londrina   25  5.5
 Londrina   25  5.3
 Londrina   28  4.6
 Londrina   28  4.3
 Londrina   28  4.9
 Londrina   31  4.4
 Londrina   31  4.1
 Londrina   31  4.4
    Sinop   22  4.5
    Sinop   22  5.2
    Sinop   22  4.6
    Sinop   25  5.7
    Sinop   25  5.9
    Sinop   25  5.8
    Sinop   28  6.0
    Sinop   28  5.5
    Sinop   28  5.8
    Sinop   31  4.5
    Sinop   31  4.6
    Sinop   31  4.3"
)
df <- read.table(text=zz, header = TRUE)

我為每個因子水平擬合一條曲線,並且需要將它們繪制在同一圖形中。

有沒有一種方法可以立即繪制所有曲線,從而避免對每個水平因子(iso)重復相同的函數“ + geom_smooth(...)”?

daf <- groupedData(diam ~ temp | iso, data = df, order = FALSE) 

ip <- ggplot(data=daf,  aes(x=temp, y=diam, colour = iso)) +  
  geom_point() + facet_wrap(~iso)

ip + geom_smooth(method = "nls", 
                method.args = list(formula = y ~ thy * exp(thq * (x-thx)^2 + thc * (x - thx)^3), 
                                   start = list(thy=5.4, thq=-0.01, thx=25, thc=0.0008)),
                se = F, size = 0.5, data = subset(daf, iso=="Itiquira")) +

  geom_smooth(method = "nls", 
              method.args = list(formula = y ~ thy * exp(thq * (x-thx)^2 + thc * (x - thx)^3), 
                                 start = list(thy=5.4, thq=-0.01, thx=25, thc=0.0008)),
              se = F, size = 0.5, data = subset(daf, iso=="Londrina")) +

  geom_smooth(method = "nls", 
              method.args = list(formula = y ~ thy * exp(thq * (x-thx)^2 + thc * (x - thx)^3), 
                                 start = list(thy=5.4, thq=-0.01, thx=25, thc=0.0008)),
              se = F, size = 0.5, data = subset(daf, iso=="Sinop")) 

在此處輸入圖片說明

您可以獲得相同的圖,而無需為每個水平因子(iso)重復相同的功能,如下所示:

ggplot(data=daf,  aes(x=temp, y=diam, colour = iso)) +  
  geom_point() +
  facet_wrap(~iso) +
  geom_smooth(method="nls",
              method.args=list(formula=y ~ thy * exp(thq * (x-thx)^2 + thc * (x - thx)^3), 
                                 start=list(thy=5.4, thq=-0.01, thx=25, thc=0.0008)),
              se = F, 
              size = 0.5)

在此處輸入圖片說明

暫無
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