R創建一個字符向量列表

Question

我正在嘗試將鄰接矩陣處理為社區列表，輸出應為向量列表（字符類型）

例如

l1[1] = c("a","b","c")
l1[2] = c("d")
l1[3] = c("e","f")

我正在嘗試在for循環中實現這一點：

l1=vector("list")

for(kn in 1:nrow(adjFinal)){
  temp = c()

  for(tm in 1:ncol(adjFinal))
    {
    if(adjFinal[kn,tm]==1)
      temp=c(temp,colnames(adjFinal)[tm])
  }

  l1[kn] = temp
}

但是我不斷收到“要替換的項目數不是替換長度的倍數”的警告，並且列出了長度為1的3個向量，例如：

l1[1] = "a"
l1[2] = "d"
l1[3] = "e"

更新：這是adjFinal：

3 x 6 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
  a b c d e f
b 1 1 1 . . .
d . . . 1 . .
e . . . . 1 1

和dput（adjFinal）：

new("dgCMatrix"
    , i = c(0L, 0L, 0L, 1L, 2L, 2L)
    , p = 0:6
    , Dim = c(3L, 6L)
    , Dimnames = list(c("b", "d", "e"), c("a", "b", "c", "d", "e", "f"))
    , x = c(1, 1, 1, 1, 1, 1)
    )

先感謝您。

Answer 1

你可以試試：

apply(adjFinal,1,function(x) colnames(adjFinal)[which(x==1)])
#$b
#[1] "a" "b" "c"
#$d
#[1] "d"
#$e
#[1] "e" "f"

考慮到您有一個稀疏矩陣，因此如果您有一個較大的矩陣，則上述方法可能效率不高，因為apply會將稀疏矩陣強制為常規矩陣。 為避免這種情況，您還可以嘗試：

adj2<-as(adjFinal,"dgTMatrix")
split(colnames(adjFinal)[adj2@j+1],adj2@i)

這將獲得相同的結果，但效率更高。