將具有不同行的多個Excel文件合並到一個熊貓中的Excel文件中

Question

我有4個Excel文件，必須將它們合並為一個Excel文件。 包含ID，姓名縮寫，年齡和性別的人口統計文件。 包含ID，首字母縮寫的測試名稱，測試日期和測試值的實驗室文件。 病歷，包含ID，姓名首字母，醫療狀況，開始和結束日期。 提供的葯物包括ID，姓名縮寫，葯物名稱，劑量，頻率，開始和結束日期。

有50位患者。 人口統計學文件包含50位患者的所有50行。 其余文件有50位患者，但行數在100到400之間，因為每位患者都有多個實驗室測試或多種葯物。

當我在大熊貓中合並時，我會將重復的實體或實體分配給錯誤的患者。 這樣做的挑戰在於，如果您給患者提供的葯物比實驗室測試多，則實驗室測試應將重復項替換為空白。

這是一個簡短的表示形式：

import pandas as pd 
lab = pd.read_excel('data/data.xlsx', sheetname='lab') 
drugs = pd.read_excel('data/data.xlsx', sheetname='drugs') 
merged_data = pd.merge(drugs, lab, on='ID', how='left')
merged_data.to_excel('merged_data.xls')

您得到以下結果： Pandas合並結果

我希望這個結果：首選輸出

Answer 1

考慮在groupby() cumcount()上使用cumcount() ，然后在兩個具有ID字段上加入：

drugs['GrpCount'] = (drugs.groupby(['ID'])).cumcount()

lab['GrpCount'] = (lab.groupby(['ID'])).cumcount()

merged_data = pd.merge(drugs, lab, on=['ID', 'GrpCount'], how='left').drop(['GrpCount'], axis=1)

#     ID Initials_x                      Drug Name          Frequency          Route   Start Date     End Date Initials_y                    Name Result Date    Result
# 0    1         AB                       AMPICLOX                NaN           Oral  21-Jun-2016  21-Jun-2016         AB  Rapid Diagnostic Test    30-May-16  Abnormal
# 1    1         AB                  CIPROFLOXACIN              Daily           Oral  30-May-2016  03-Jun-2016         AB              Microscopy   30-May-16    Normal
# 2    1         AB        Ibuprofen Tablet 400 mg    Two Times a Day           Oral  06-Oct-2016  10-Oct-2016        NaN                     NaN         NaN       NaN
# 3    1         AB                        COARTEM                NaN           Oral  17-Jun-2016  17-Jun-2016        NaN                     NaN         NaN       NaN
# 4    1         AB          INJECTABLE ARTESUNATE          12 Hourly    Intravenous  01-Jun-2016  02-Jun-2016        NaN                     NaN         NaN       NaN
# 5    1         AB                  COTRIMOXAZOLE              Daily           Oral  30-May-2016  12-Jun-2016        NaN                     NaN         NaN       NaN
# 6    1         AB                  METRONIDAZOLE    Two Times a Day           Oral  30-May-2016  03-Jun-2016        NaN                     NaN         NaN       NaN
# 7    2         SS                     GENTAMICIN              Daily    Intravenous  04-Jun-2016  04-Jun-2016         SS              Microscopy    6-Jun-16  Abnormal
# 8    2         SS                  METRONIDAZOLE           8 Hourly    Intravenous  04-Jun-2016  06-Jun-2016         SS    Complete Blood Count    6-Oct-16  Recorded
# 9    2         SS  Oral Rehydration Salts Powder                PRN           Oral  06-Jun-2016  06-Jun-2016        NaN                     NaN         NaN       NaN
# 10   2         SS                           ZINC           8 Hourly           Oral  06-Jun-2016  06-Jun-2016        NaN                     NaN         NaN       NaN