[英]Calculate degree of a subgraph using r igraph
我知道全局圖的程度,但是現在我需要找到子圖中的節點的程度。 因此,約翰在學校有4個朋友,但在班上有3個朋友。 我該如何指示igraph數他班上的那三個朋友,而不是他學校里的其余三個朋友?
我的全球圖
library(igraph)
school <- read.table(text="
A B C D E F G
A 0 1 0 1 0 1 1
B 1 0 1 1 0 1 0
C 0 0 0 0 0 0 1
D 1 1 0 0 1 0 0
E 0 0 0 1 0 1 1
F 0 1 0 0 1 0 1
G 1 0 1 0 1 1 0", header=TRUE)
mat <- as.matrix(school)
g <- graph.adjacency(mat, mode="undirected", add.rownames = T)
我對P,Q和R類的隸屬關系矩陣
x <- read.table(text="
P Q R
A 1 1 0
B 0 0 1
C 0 0 0
D 1 0 1
E 1 1 0
F 0 1 0
G 1 1 1", header=TRUE)
inc <- as.matrix(x)
ginc <- graph.incidence(inc)
我的P類子圖
class_nodes <- names(which(inc[,"P"] == 1))
class_adj <- mat[class_nodes, class_nodes]
class_graph <- graph.adjacency(class_adj, mode = "undirected")
我需要計算子圖“ class_graph”中的節點的程度,但只計算它們在子圖中的聯系,而不是全局圖。
您可以使用找到P類中的所有節點(我們專門提取了名稱,以便可以在其他圖形對象中查找它們)。
V(ginc)[.nei("P")]$name
然后您可以使用以下方法從主圖中提取連接的子集
subg <- induced.subgraph(g, V(ginc)[.nei("P")]$name)
您可以使用
degree(subg)
# A D E G
# 2 2 2 2
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