如何在現有HDF5數據集中插入/編輯列

Question

我有一個HDF5文件，如下所示。 我想編輯索引列並創建一個新的時間戳索引。 有什么辦法嗎？

Answer 1

除非您首先具有用於創建HDF5文件的方案/規范，否則這是不可能的。

如果您嘗試使用HDF5文件（如電子表格）（甚至通過h5py），可能會出錯。 例如：

• 塊形狀，壓縮，數據類型不一致。
• 同類數據變得非同類。

您可以做的是將列表作為屬性添加到數據集。 實際上，這可能是正確的事情。 下面的示例代碼，輸入為字典。 當您讀入數據時，會將屬性鏈接到同類數據（按行，列或其他標識符）。

def add_attributes(hdf_file, attributes, path='/'):

    """Add or change attributes in path provided.
    Default path is root group.
    """

    assert os.path.isfile(hdf_file), "File Not Found Exception '{0}'.".format(hdf_file)
    assert isinstance(attributes, dict), "attributes argument must be a key: value dictionary: {0}".format(type(attributes))

    with h5py.File(hdf_file, 'r+') as hdf:
        for k, v in attributes.items():
            hdf[path].attrs[k] = v

    return "The following attributes have been added or updated: {0}".format(list(attributes.keys()))