將R“ tvReg”軟件包安裝到HPC群集

Question

我正在嘗試在本地文件夾中安裝一些軟件包。 我只是寫

install.packages("tvReg" , repos = "http://cran.us.r-project.org")

在我的R腳本之上。 結果似乎與其他軟件包一樣正在安裝該軟件包，但是當我想使用它時

library(tvReg)

它顯示一個錯誤，告訴您沒有這樣的軟件包。

我檢查了my-R-libs文件夾，安裝后沒有tvReg。 我還嘗試直接從GitHub鏈接https://github.com/cran/tvReg復制軟件包文件，但是這次錯誤顯示這不是有效的軟件包，並將其從文件夾中刪除。 我要使用的所有其他軟件包均正常運行，這是我無法安裝的唯一軟件包。

Answer 1

最有可能的是，安裝未成功完成。 該軟件包取決於許多其他軟件包。 嘗試再次安裝它，並注意最后幾行。 您應該看到以下幾行：

** package 'tvReg' successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (tvReg)

安裝完成后，對其進行測試：

library("tvReg")
# Loading required package: Matrix
# Funded by the Horizon 2020. Framework Programme of the European Union.

您還可以執行以下命令： .libPaths() 。 它將列出R將搜索軟件包的目錄。 您的用戶目錄應該在該列表上。 安裝R軟件包時，默認情況下將使用此目錄。