将R“ tvReg”软件包安装到HPC群集

Question

我正在尝试在本地文件夹中安装一些软件包。 我只是写

install.packages("tvReg" , repos = "http://cran.us.r-project.org")

在我的R脚本之上。 结果似乎与其他软件包一样正在安装该软件包，但是当我想使用它时

library(tvReg)

它显示一个错误，告诉您没有这样的软件包。

我检查了my-R-libs文件夹，安装后没有tvReg。 我还尝试直接从GitHub链接https://github.com/cran/tvReg复制软件包文件，但是这次错误显示这不是有效的软件包，并将其从文件夹中删除。 我要使用的所有其他软件包均正常运行，这是我无法安装的唯一软件包。

Answer 1

最有可能的是，安装未成功完成。 该软件包取决于许多其他软件包。 尝试再次安装它，并注意最后几行。 您应该看到以下几行：

** package 'tvReg' successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
* DONE (tvReg)

安装完成后，对其进行测试：

library("tvReg")
# Loading required package: Matrix
# Funded by the Horizon 2020. Framework Programme of the European Union.

您还可以执行以下命令： .libPaths() 。 它将列出R将搜索软件包的目录。 您的用户目录应该在该列表上。 安装R软件包时，默认情况下将使用此目录。