如何使用Python保存ImageJ Tiff元數據

Question

我正在嘗試使用tifffile保存tiff堆棧，並使用此解決方案添加ImageJ tiff元數據標記和值。

該代碼運行沒有錯誤，但是當我在ImageJ中打開“圖像信息”時，看不到我創建的新標簽。

我真的不知道Tiff標簽是如何工作的，所以我選擇了一個名為“名稱”的標簽，因為當我打開用ImageJ保存的元數據時，該標簽名稱存在。

我只更改了原始解決方案中的功能以支持我的標簽。 這是我正在使用的代碼：

def imagej_metadata_tags(metadata, byteorder):
    """Return IJMetadata and IJMetadataByteCounts tags from metadata dict.

    The tags can be passed to the TiffWriter.save function as extratags.

    """
    header = [{'>': b'IJIJ', '<': b'JIJI'}[byteorder]]
    bytecounts = [0]
    body = []

    def writestring(data, byteorder):
        return data.encode('utf-16' + {'>': 'be', '<': 'le'}[byteorder])

    def writedoubles(data, byteorder):
        return struct.pack(byteorder+('d' * len(data)), *data)

    def writebytes(data, byteorder):
        return data.tobytes()

    metadata_types = [
        ('Name', b'Name', 1, writestring),
    ]

    for key, mtype, count, func in metadata_types:
        if key not in metadata:
            continue
        if byteorder == '<':
            mtype = mtype[::-1]
        values = metadata[key]
        if count is None:
            count = len(values)
        else:
            values = [values]
        header.append(mtype + struct.pack(byteorder+'I', count))
        for value in values:
            data = func(value, byteorder)
            body.append(data)
            bytecounts.append(len(data))

    body = b''.join(body)
    header = b''.join(header)
    data = header + body
    bytecounts[0] = len(header)
    bytecounts = struct.pack(byteorder+('I' * len(bytecounts)), *bytecounts)
    return ((50839, 'B', len(data), data, True),
            (50838, 'I', len(bytecounts)//4, bytecounts, True))

ijtags = imagej_metadata_tags({'Name': 'DPY'}, '>')

tif.imsave(some_path, frame, imagej=True, extratags=ijtags)

Answer 1

IJMetadata標記只能包含特定於應用程序的信息。 請參見imagej_metadata_tag函數的說明。 您可以指定metadata={'Name': 'A name'}來將其他元數據保存在ImageDescription標記中。 ImageJ可能會或可能不會使用此信息。 沒有記錄ImageJ使用的TIFF標簽。