如何為使用 python 保存的 tiff 圖像設置像素大小，以便在 ImageJ 中將像素高度和寬度設置為特定值？

Question

從 numpy 數組創建 tiff 圖像文件有多種方法 {PIL、opencv、tifffile 等}。 如何為使用 python 保存的 tiff 圖像設置像素大小，以便像素高度和寬度在 ImageJ 中具有特定值？

在 ImageJ 中打開 tiff 圖像時，Ctrl+Shift+P 會打開一個圖像屬性窗口，例如：

有 tiff 標簽，包括 XResolution、YResolution、ResolutionUnit、PixelXDimension、PixelYDimension 等。 哪些（如果有）可用於設置保存圖像的屬性，以便 ImageJ 使用指定的像素寬度和高度？ 哪些軟件包可以在保存過程中設置此類標簽？

Answer 1

tifffile 的創建者 Christoph Gohlke 好心地教了我兩件事：

1. 如果將分辨率元組傳遞給 tifffile.imsave，tifffile 將設置 XResolution、YResolution 和 ResolutionUnit 標簽。 在tif 旁邊保存圖像元數據的最佳方法是什么？ 來自 Jenny Folkesson，我添加了一個分辨率元組

   tifffile.imsave( my_tiff, float64_im.astype('float32'), ijmetadata=ijmetadata, description=description, extratags=extra_tags, resolution=(1/pixel_pitch_in_cm, 1/pixel_pitch_in_cm, 'CENTIMETER'))

2. ImageJ 不容易打開具有 64 位浮點數據的 tiff。 解決方法是在將圖像傳遞給 tifffile.imsave 之前將其轉換為“float32”。