如何为使用 python 保存的 tiff 图像设置像素大小，以便在 ImageJ 中将像素高度和宽度设置为特定值？

Question

从 numpy 数组创建 tiff 图像文件有多种方法 {PIL、opencv、tifffile 等}。 如何为使用 python 保存的 tiff 图像设置像素大小，以便像素高度和宽度在 ImageJ 中具有特定值？

在 ImageJ 中打开 tiff 图像时，Ctrl+Shift+P 会打开一个图像属性窗口，例如：

有 tiff 标签，包括 XResolution、YResolution、ResolutionUnit、PixelXDimension、PixelYDimension 等。 哪些（如果有）可用于设置保存图像的属性，以便 ImageJ 使用指定的像素宽度和高度？ 哪些软件包可以在保存过程中设置此类标签？

Answer 1

tifffile 的创建者 Christoph Gohlke 好心地教了我两件事：

1. 如果将分辨率元组传递给 tifffile.imsave，tifffile 将设置 XResolution、YResolution 和 ResolutionUnit 标签。 在tif 旁边保存图像元数据的最佳方法是什么？ 来自 Jenny Folkesson，我添加了一个分辨率元组

   tifffile.imsave( my_tiff, float64_im.astype('float32'), ijmetadata=ijmetadata, description=description, extratags=extra_tags, resolution=(1/pixel_pitch_in_cm, 1/pixel_pitch_in_cm, 'CENTIMETER'))

2. ImageJ 不容易打开具有 64 位浮点数据的 tiff。 解决方法是在将图像传递给 tifffile.imsave 之前将其转换为“float32”。