[英]How to run for loop R program faster?
我正在使用以下r code
來計算每個i = 1,2,...,200
左側和右側的對數似然。
但是我想對大量生成的數據集執行此過程,例如a = 10000
並將整個循環迭代1000
次。 如何加速以下程序? 我可以使用apply
函數而不是for
函數嗎?
先感謝您!
n1 = 100
n2 = 100
a = 1000
n= n1 + n2
# number of simulated copies of y
sim.data = matrix(NA, nrow = n, ncol = a)
for (i in 1:a) {
#for(j in 1:a){
sim.data[,i] = c(rnorm(n1, 2, 1), rnorm(n-n1, 4, 1))
#}
}
dim(sim.data)
# Compute the log-likelihood
B = ncol(sim.data)
loglike_profb = matrix(NA, n - 1, B)
for (j in 1:B) {
for (i in 1:(n - 1)) {
loglike_profb[i, j] = -0.5*(sum(((sim.data[1:i,j]) - mean(sim.data[1:i,j]))^2) + sum(((sim.data[(i + 1):n,j]) - mean(sim.data[(i +1):n,j]))^2))
}
}
你可以把 loglike_profb 的計算放到一個函數中,然后使用mapply
loglike_profb_func <- function(i,j){
-0.5*(sum(((sim.data[1:i,j]) - mean(sim.data[1:i,j]))^2) + sum(((sim.data[(i + 1):n,j]) - mean(sim.data[(i +1):n,j]))^2))
}
mapply(loglike_profb_func, rep(1:(n-1),B), rep(1:B,(n-1)))
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