MuMin 中的 dredge() function 錯誤

Question

我正在嘗試使用 dredge() function 通過完成變量的每個組合（每個模型最多五個變量）並使用針對小樣本量（AICc）校正的 AIC 比較模型來評估模型。

但是，我收到一個錯誤和兩個警告消息，如下所示：

固定術語是“（攔截）”警告消息：1：在挖泥機中（MaxN.model，m.min = 2，m.max = 5）：比較由 REML 擬合的模型 2：在挖泥機中（MaxN.model，m.min = 2, m.max = 5): arguments 'm.min' 和 'm.max' 已棄用，請改用 'm.lim'

我嘗試按照指定更改為“m.lim”，但出現錯誤：

疏浚錯誤（MaxN.model，m.lim = 5）：無效的“m.lim”值另外：警告消息：在疏浚中（MaxN.model，m.lim = 5）：比較由 REML 擬合的模型

我正在使用的代碼是：

MaxN.model<-lme(T_MaxN~Seagrass.cover+composition.pca1+composition.pca2+Sg.Richness+traits.pca1+
              land.use.pc1+land.use.pc2+seascape.pc2+D.landing.site+T_Depth, 
                random=~1|site, data = sgdf, na.action = na.fail, method = "REML")
Dd_MaxN<-dredge(MaxN.model, m.min = 2 , m.max = 5)

我究竟做錯了什么？

Answer 1

1. 您沒有告訴我們您嘗試為m.lim指定什么。 ?dredge說：

m.lim ...（可選）單個 model 中術語數量的限制“c（下，上）”

所以你應該指定一個二元素數值（整數）向量。

2. 您絕對應該使用method="ML"而不是method="REML" 。 REML 的警告/錯誤非常嚴重； 比較通過 REML 擬合的具有不同固定效應的模型將導致胡說八道。

所以你應該嘗試：

MaxN.model <- lme(..., method = "ML")  ## where ... is the rest of your fit
Dd_MaxN <- dredge(MaxN.model, m.lim=c(2,5))