[英]How to create a plot from the output of a function in R
我有一個函數可以計算基因 (x) 中表達水平向量的對數似然; 例如 -0.465、0.111、-0.437。 計算的西格瑪值為 0.4717,a = 0.8861。
loglike <- function(x,theta,sigma,a) {
sum(log(theta/(2*a)*(x<a)*(x>-a) + (1-
theta)*dnorm(x,mean=0.0,sd=sigma)))
}
我想將 theta 的可能值向量輸入到函數中,並用每個 theta 值繪制函數的結果。 所以我想到了一個 for 循環來旋轉函數中 theta 的所有值,以從 loglike 函數的輸出創建一個值列表。 然后根據對數結果創建一個 theta 圖。
theta <- seq(0,1,0.01)
result_ <- c()
for (i in 1:length(theta)) {
result <- loglike(x,i,sigma,a)
result_[i] <- result[i]
}
但這只是給了我警告信息:
Warning messages:
1: In log(theta/(2 * a) * (x < a) * (x > -a) + (1 - theta) *
dnorm(x, :
NaNs produced
我知道該函數有效,因為當我一次使用一個函數時,它會返回值,例如
loglike(x,0,sigma,a)
> -333.454234
我對 R 作為一種語言不是很有信心,所以非常感謝任何幫助。
感謝您添加 x、a 和 sigma 的值:這些使我能夠找到您的錯誤。
在這個循環中:
for (i in 1:length(theta)) {
result <- loglike(x,i,sigma,a)
result_[i] <- result[i]
}
您將i
作為 theta 的值輸入到 loglike 函數中。 請記住, i
是從 1 到 101 的循環的索引號,但是您需要循環每個循環的 theta 值,因此它應該是theta[i]
。
此外,因為您的loglike
函數只返回一個數字,所以您將一個數字存儲到result
,然后嘗試將result[i]
存儲到result_[i]
。 當循環超過 i = 1 時,您正在嘗試移動一個不存在的數字。
這是一個完整的工作示例:
loglike <- function(x, theta, sigma, a)
{
sum(log((theta / (2*a)) * (x < a) * (x > -a) +
(1 - theta) * dnorm(x, mean = 0.0, sd = sigma)))
}
x <- 0.111
sigma <- 0.4717
a <- 0.8861
theta <- seq(0, 1, 0.01)
result <- numeric()
for (i in 1:length(theta)) result[i] <- loglike(x, theta[i], sigma, a)
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