OSX 中的 Cython openMP ......沒有構建

Question

我現在正在戰斗 3 天來設置我的 venv ......我需要 cython、openmp......我的 IDE 是 macOS 中的 PyCharm Prof......我已經嘗試了很多解決方案但沒有結果......

當我嘗試使用 PyCharm 構建時……構建結果是：

UserWarning: Unknown distribution option: 'cmd_class' warnings.warn(msg)
usage: setup.py [global_opts] cmd1 [cmd1_opts] [cmd2 [cmd2_opts] ...]
   or: setup.py --help [cmd1 cmd2 ...]
   or: setup.py --help-commands
   or: setup.py cmd --help

error: no commands supplied

所以，當我嘗試使用： python setup.py install build_ext --inplace沒有再次構建......錯誤如下：

ld: warning: directory not found for option '-L/install/prefix/lib'
ld: warning: -L path '/usr/local/Cellar/llvm/9.0.1/lib/libomp.dylib' is not a directory
ld: warning: directory not found for option '-L/install/prefix/lib'
ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/Cellar/gcc/9/gcc/x86_64-apple-darwin19/9.3.0/include/omp.h'
ld: library not found for -lomp
clang-9: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
error: command '/usr/local/opt/llvm/bin/clang++' failed with exit status 1

我已經安裝： brew install llvm brew install libomp

clang version 9.0.1
Target: x86_64-apple-darwin19.3.0
Thread model: posix
InstalledDir: /usr/local/opt/llvm/bin

setup.py 是根據https://cython.readthedocs.io/en/latest/src/userguide/parallelism.html但我嘗試了很多不同的 mods ......我現在正在嘗試設置 3 天。 ..

最后...我知道編譯完成時有錯誤。 雖然如果我嘗試運行它......我有以下結果......也許它有幫助......

ImportError: dlopen(myfile.pyx, 2): Symbol not found: _omp_get_num_threads
  Referenced from: myfile.pyx
  Expected in: flat namespace
 in myfile.pyx.cpython-36m-darwin.so

我在某處讀到過使用 openMP 無法在 OSX Cython-App 中實現，但我仍然相信有辦法......我的系統是 macOS Catalina 10.15.3 ......我需要你的幫助！ ！

Answer 1

最后我找到了解決方案......

1. 在你的 venv 中：

pip install Cython setuptools

2. 找到你的 gcc 編譯器在哪里......如果你已經安裝了，請執行以下操作，其他情況下查找並安裝一個......

$ mdfind gcc | grep gcc

3. 將整個 gcc 目錄放在項目的 venv 中。 （路徑： /My_Project/venv/gcc ）

4. 和setup.py應該如下......（路徑： /My_Project/package/setup.py ）

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize
from Cython.Distutils import build_ext
import os

os.environ["CC"]="../venv/gcc/9.3.0/bin/gcc-9"
os.environ["CXX"]="../venv/gcc/9.3.0/bin/gcc-9"

ext_modules = [Extension(
        "filename",
        ["filename.pyx"],
        language='c',
        extra_compile_args=['-fopenmp',"-Os",],
        extra_link_args=['-fopenmp', ],
    )
]

setup(
    name='filename',
    cmd_class = {'build_ext': build_ext},
    ext_modules= cythonize(ext_modules),
)

5. 您的 cython 文件： filename.pyx ... 可以以filename.pyx頂部的編譯器指令注釋開頭，如下所示：

# distutils: extra_compile_args = -fopenmp
# distutils: extra_link_args = -fopenmp

6. 在你的 venv 中運行編譯命令：

$ python setup.py build_ext -i

7. 最后你可以在你的代碼中導入你的 cython 文件......在你的 python 文件的頂部等等mycode.py ：

import filename

filename.myCythonFunc()

以上給出了 OSX-10.15.3 macOS Catalina 的解決方案。