netcdf4-python：讀取變量存儲參數

Question

我試圖手動將 NetCDF 文件的所有維度、變量和屬性復制到新文件中。 與使用 python 復制 netcdf 文件一樣，這很有效，除了像“fill_value”或“chunksizes”這樣的存儲參數。 在ncdump -sch ，這些參數用前導下划線 (_) 顯示：

    float var1(time, lat, lon) ;
        var1:_FillValue = NaNf ;
        var1:grid_mapping = "crs" ;
        var1:unit = "m" ;
        var1:_Storage = "chunked" ;
        var1:_ChunkSizes = 1, 14, 146 ;
        var1:_DeflateLevel = 9 ;
        var1:_Shuffle = "true" ;
        var1:_Endianness = "little" ;

在createVariable 中，我可以為新變量設置這些參數，但是如何使用 netcdf4-python 模塊從現有文件中獲取諸如“fill_value”或“chunksizes”之類的參數？ 讀取這些參數的語法是什么？

Answer 1

有關塊大小的信息，您可以對變量使用chunking()方法。 不幸的是，如果將_FillValue設置為非默認值，您似乎只能訪問它：

from netCDF4 import Dataset
import numpy as np

nc = Dataset('data.nc', 'w')
nc.createDimension('t', 10)
var = nc.createVariable('temp', 'f', ('t',), fill_value=80)
var[:] = np.arange(10)
nc.close()

nc_read = Dataset('data.nc')
temp = nc_read.variables['temp']
print(temp.chunking())
print(temp._FillValue)

所以現在看起來處理填充值的最簡單方法是：

fill = getattr(temp, '_FillValue', mydefaultvalue)

可能值得在GitHub 上向上游提出問題。

Answer 2

謝謝，這就像一個魅力！ 我已經解決了處理未定義的_FillValue現在像：

try: fillVal = variable._FillValue
except: fillVal = netCDF4.default_fillvals[str(variable.dtype.kind)+str(variable.dtype.itemsize)]

看起來有點復雜，但似乎dtype對於default_fillvals的預期輸入沒有輸出格式方法