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在 Python 中將字節數組轉換為 16 位灰度圖像

[英]Converting byte array to 16 bit grayscale image in Python

我正在處理以非標准圖像格式 (.Tsm) 存儲的大型圖像數據集。 本質上它是一個二進制文件,開頭有一些頭文件,與 FITS 標准非常相似,只是存儲在 little-endian 而不是 FITS big-endian。

讀取文件 header 並格式化元數據后,我可以使用以下代碼讀取單個圖像

    def __read_slice(self, file, img_num, dimensions):
        """Read a single image slice from .tsm file"""

        pixel_range = self.metadata["pixel range"]
        bytes_to_read = self.metadata["bytes to read"]

        # position file pointer to correct byte
        file.seek(self.HEADER_TOTAL_LEN + (bytes_to_read * img_num), 0)

        all_bytes = file.read(bytes_to_read)  # read image bytes
        img = np.empty(len(pixels), dtype='uint16')  # preallocate image vector

        byte_idx = 0
        for idx, pixel in enumerate(pixel_range):
            img[idx] = (all_bytes[byte_idx + 1] << 8) + all_bytes[byte_idx]
            byte_idx += 2

        return np.reshape(img, (dimensions[1], dimensions[0]))  # reshape array to correct dimensions 

問題是圖像可能非常大(2048x2048),因此即使只是加載 20-30 幀進行處理也可能需要大量時間。 我是 python 的新手,所以我猜這里的代碼效率很低,尤其是循環。

有沒有更有效的方法將字節數據轉換為 16 位整數?

你可以試試:

img= np.frombuffer(all_bytes, dtype='uint16')

例子:

>>> np.frombuffer(b'\x01\x02\x03\x04', dtype='uint16')
array([ 513, 1027], dtype=uint16)

暫無
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