[英]Understanding facet_grid scale=“free”
我想將 facet_grid 與 stat_compare_means 一起使用,並為 y 設置單獨的比例。 我認為 scale = "free" 會處理它,但事實並非如此。 我的名稱因子中的“B”級未正確縮放。
library(tidyverse)
library(ggpubr)
set.seed(2)
my_comparisons <- list(c("Cond1","Cond2"),
c("Cond2","Cond3"),
c("Cond1","Cond3"))
nrName <- 4
nrCond <- 3
nrValue <- 5
Name <- rep(c("A","B","C","D"),each=nrValue*nrCond)
Condition <- rep(c("Cond1","Cond2","Cond3"),length.out=nrName*nrCond*nrValue)
Score <- c(rnorm(nrValue*nrCond,6,1),rnorm(nrValue*nrCond,0.01,0.01),rnorm(nrValue*nrCond,7,1),rnorm(nrValue*nrCond,7,1))
df <- data.frame(Name = Name, Condition = Condition, Score = Score)
plt <- ggplot(df,
aes(x= Condition,y= Score, fill= Condition))+
#geom_flat_violin(position = position_nudge(x = .2),adjust = 2)+
geom_point(position = position_jitter(width = .15), size = .25)+
geom_boxplot(outlier.shape = NA, alpha = 0.3, width = .1, colour = "BLACK") +
facet_grid(reformulate("Name","."),scales = 'free')+
scale_y_continuous(expand = expansion(mult = c(0, 0.1)))+
stat_compare_means(
comparisons = my_comparisons,
method = "t.test",paired = TRUE,
label.y.npc = 0.1)
print(plt)
我認為這可能與 stat_compare_means 中的標簽有關。 但是刪除 stat_compare_means 會產生類似的結果。
我在這里沒有考慮什么?
我現在看到了我的困惑。 正如 RonakShah 正確指出的那樣,我在原始代碼中使用了 PupillometryR 中的 geom_flat_violin。 當我在這里寫這篇文章時,我想簡化問題,這就是我展示箱線圖的原因。 如果我重新添加帶有 geom_flat_vioilin 的行,並按照 Suren 的建議使用 greom_wrap,則 scale = "free" 選項不再起作用。
ggplot(df,
aes(x= Condition,y= Score,fill= Condition))+
geom_flat_violin(position = position_nudge(x = .2))+
geom_point(position = position_jitter(width = .15), size = .25)+
geom_boxplot(outlier.shape = NA, alpha = 0.3, width = .1, colour = "BLACK") +
facet_wrap(reformulate("Name","."),scales = 'free',nrow = 1)+
scale_y_continuous(expand = expansion(mult = c(0, 0.1)))
我想我必須查看 geom_flat_violin function 以進行進一步調試。
例如,而不是facet_grid
使用facet_wrap
,
facet_wrap(reformulate("Name","."), scales = 'free', nrow = 1) +
使用facet_grid
不能同時獲得 x 和 y 尺度; 見這里https://github.com/tidyverse/ggplot2/issues/1152
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