我正在嘗試在 devtools package 中使用 install_github 但失敗了

Question

我從 2015 年初開始在 macbook pro 上使用 Sierra MacOS 10.12.6 並運行 rstudio 1.2.5033 和 R 4.0.3。誰能告訴我如何解決這個問題？

首先，我收到以下錯誤：

使用來自 envvar GITHUB_PAT 的 github PAT 錯誤：無法從 GitHub 安裝“未知包”：HTTP 錯誤憑證 401。

然后我通過 Sys.unsetenv("GITHUB_PAT") 取消設置這個 PAT

但是，現在我得到另一個錯誤，如下例所示，並且在安裝任何 github package 時會發生這種情況，幾乎相同，甚至是下面的“第 34 行”。 dyld 符號綁定和符號未找到錯誤總是發生，我也總是在文件（con，“r”）中得到相同的警告。 這個 dyld 錯誤似乎與我的操作系統小於 10.13 的事實有關

我想這可能會回答這個問題，但實際上我需要更新操作系統嗎？

Downloading GitHub repo jeremyrcoyle/gentmle2@HEAD ✓ checking for file '/private/var/folders/vf/l0sx2pbj71jdsknd5dq5p2c00000gp/T/Rtmp1Z3KtE/remotes3db121f76e4/jeremyrcoyle-gentmle2-20d253b/DESCRIPTION'... ─ preparing 'gentmle2': ✓ checking DESCRIPTION元信息...文件中的警告（con，“r”）：無法打開文件'/var/db/timezone/zoneinfo/+VERSION'：沒有這樣的文件或目錄─檢查源代碼中的LF行結尾並制作文件和 shell 腳本 ─ 檢查空目錄或不需要的目錄 ─ 構建“gentmle2_0.1.0.9000.tar.gz”

dyld：惰性符號綁定失敗：未找到符號：_utimensat 引用自：/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/lib/libR.dylib（為 Mac OS X 10.13 構建）預期在：/usr /lib/libSystem.B.dylib

dyld：未找到符號：_utimensat 引用自：/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.0/Resources/lib/libR.dylib（為 Mac OS X 10.13 構建）預期在：/usr/lib/libSystem。 B.dylib

/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/INSTALL：第 34 行：2818 完成 echo 'tools:::.install_packages()' 2819 中止陷阱：6 | R_DEFAULT_PACKAGES= LC_COLLATE=C "${R_HOME}/bin/R" $myArgs --no-echo --args ${args} 錯誤：無法從 GitHub 安裝“gentmle2”：（從警告轉換）安裝 ZEFE90A8E604A7C840E8DZ'/A var/folders/vf/l0sx2pbj71jdsknd5dq5p2c00000gp/T//Rtmp1Z3KtE/file3db4fb67c07/gentmle2_0.1.0.9000.tar.gz' 具有非零退出狀態

Answer 1

根據 R 下載頁面，R 版本 4.xx 需要 macOS 10.13 或更高版本。 您的兩個選擇是更新您的操作系統或下載並安裝舊版本的 R 例如 R-3.6.3.nn.pkg ( https://cran.r-project.org/bin/macosx/ )