圓形系統發育名稱削減

Question

我試圖將系統發育放在復合 plot 的中間。 但是，我找不到合適的設置，因為頂部和底部的名稱或左右兩側的名稱都被剪切了。
我找到的唯一解決方案是減少 cex （分類名稱的大小），但它看起來真的很傻，因為分類名稱很小。

簡單的可重現示例：

library(ape)
par(fig=c(0.25, 0.75, 0.25,0.75))
data(bird.orders)
plot(bird.orders, type = "fan", use.edge.length = T)

任何想法如何解決這個問題？ 與分類群名稱相比，如果我可以縮小 plot 的分支長度部分，那將是理想的。

Answer 1

xpd圖形參數允許文本到剪切區域之外的 plot。 嘗試par(xpd = NA) ：

library(ape)
par(fig=c(0.25, 0.75, 0.25,0.75), xpd = NA)
data(bird.orders)
plot(bird.orders, type = "fan", use.edge.length = T)

您可以使用cex參數更改文本大小與邊長的比率並擴大fig區域，因為您提到了您的問題。