如何以二進制格式存儲來自 NEST 模擬器的記錄數據？

Question

我正在嘗試將spikedetector 數據以二進制格式寫入.gdf 文件，但我不能。

我將spikedetector的binary參數設置為True （我使用nest.GetStatus檢查了它）但是文件是用ASCII編寫的：

neurons = nest.Create('iaf_psc_alpha', 5)
sr = nest.Create('spike_recorder')
nest.Connect(neurons, sr)
sr.SetStatus({'binary': True})

我正在使用 NEST 2.18

Answer 1

NEST 2.18 和 2.20 的文檔在這方面具有誤導性。 binary選項沒有效果，早就應該被刪除（它在打開文件時設置了ios::binary標志，但這不會產生重大影響）。

如果您想以二進制格式編寫峰值，您需要切換到 NEST 3.0（在撰寫本文時未發布但在master中可用）並通過設置記錄器的record_to屬性來使用sionlib 記錄后端：

neurons = nest.Create('iaf_psc_alpha', 5)
sr = nest.Create('spike_recorder')
nest.Connect(neurons, sr)
sr.SetStatus({'record_to': 'sionlib'})

更新：NEST 3.0 現已發布，包括文檔中模擬記錄的完整指南。 提到的二進制 sionlib 后端是其中的一部分。