如何以二进制格式存储来自 NEST 模拟器的记录数据？

Question

我正在尝试将spikedetector 数据以二进制格式写入.gdf 文件，但我不能。

我将spikedetector的binary参数设置为True （我使用nest.GetStatus检查了它）但是文件是用ASCII编写的：

neurons = nest.Create('iaf_psc_alpha', 5)
sr = nest.Create('spike_recorder')
nest.Connect(neurons, sr)
sr.SetStatus({'binary': True})

我正在使用 NEST 2.18

Answer 1

NEST 2.18 和 2.20 的文档在这方面具有误导性。 binary选项没有效果，早就应该被删除（它在打开文件时设置了ios::binary标志，但这不会产生重大影响）。

如果您想以二进制格式编写峰值，您需要切换到 NEST 3.0（在撰写本文时未发布但在master中可用）并通过设置记录器的record_to属性来使用sionlib 记录后端：

neurons = nest.Create('iaf_psc_alpha', 5)
sr = nest.Create('spike_recorder')
nest.Connect(neurons, sr)
sr.SetStatus({'record_to': 'sionlib'})

更新：NEST 3.0 现已发布，包括文档中模拟记录的完整指南。 提到的二进制 sionlib 后端是其中的一部分。