在 R 中執行 GAM（mgcv 包）時出現“model.matrix.formula(form, data) 中的錯誤：數據必須是 data.frame”

Question

尋求一個友好的靈魂，知道如何解決這個錯誤或者理解為什么會出現這個錯誤。

不完全確定發生了什么，但每次我嘗試使用隨機效果（ bs="re" ，使用mgcv包）進行 GAM 時都會出現此錯誤。 這很奇怪，因為不僅出現在新模型上，甚至出現在以前工作的模型上（多次）。 我確保數據沒有 NA、科學數據或隨機公式。 此外，我沒有使用日期格式來避免錯誤，以前是這樣工作的。

我還嘗試通過as.data.frame(x)將數據轉換為數據框，但發生了同樣的錯誤。

我一直在玩這個公式，似乎每次出現隨機效應bs="re"時，無論是其中的 2 個（站點、州）還是只有其中一個（站點），都會出現錯誤發生。 如果我將它們完全排除在公式之外，它就會完美地工作。

我想這可能是：

1. 與我可能已經安裝的另一個 package 存在一些不兼容性，但試圖解決這個問題但沒有任何效果。 刪除了所有最近安裝的軟件包，錯誤仍然存在。

2. 其他可能是對mgcv package 的任何更新？

更新：它適用於 R 軟件，但不適用於 R 工作室。

有沒有人知道如何解決這個問題或為什么會出現這個問題

以下 model 以前可以工作但不再工作，每次都給我提到的錯誤

gam_2a <- gam(Total_Items ~ s(DayI0, k=14) + s(Site, State, bs="re"), offset(log(EffortDayC)),data = x,family=poisson(link="log"),method = "REML")

變量說明：

Total_Items = 每個事件發現的碎片數量；

DayI0 = 自第一次清理后的天數（數字）；

地點 = 抽樣地點（地點在州內）；

State = State 的采樣；

EffortDayC = Effort(海灘長度、志願者人數、采樣時間)*DayC(采樣間隔)；

下面的str(x) output：

在此處輸入圖像描述

和頭部的數據更好理解一點： enter image description here enter image description here

Answer 1

排序！ package agricolae導致與mgcv package 不兼容。