轉換為argparse時，字符串索引超出范圍

Question

我從optparse更改為argparse，但是當我嘗試運行它時，我收到以下錯誤：

    if not option_string[0] in self.prefix_chars:
IndexError: string index out of range

我的代碼是：

usage = "%prog -f <fasta TFs> -a <database all> -s <database small> -d <pfam database> [options]"
version = "1.0.1"
description = " "
epilog = " "\
         " "
parser = argparse.ArgumentParser(usage=usage, description=description,
                      version="%prog "+version, epilog=epilog)

# options for running the program
# TF file
parser.add_argument("-f", "",  dest="TF", metavar="<file>",
                        help="input file with transcription factors")
parser.set_defaults(fasta=None)

我無法找到此錯誤的來源，如何解決這個問題？

Answer 1

在argparse中，您無法將空參數字符串傳遞給add_argument。 argparse試圖在您傳遞的空字符串（“”）中找到有效的prefix_char（例如“ - ”或“ - ”），從而導致錯誤。 試試這個：

parser.add_argument("-f",  dest="TF", metavar="<file>",
                    help="input file with transcription factors")

Answer 2

獲取此錯誤的唯一方法是請求不存在的索引 - 在這種情況下， option_string必須為空。